人工流产手术和药物流产有各自不同的副作用。所以不能简单的比较哪一个比较好。药物流产有完全流产和不全流产的结局。是完全流产的结局，副作用相对比较小，是比较好的。但是万一发生不全流产，需要紧急清宫止血治疗。
打抬药流比较好一些，因为药流对子宫的损伤，尤其是子宫内膜的损伤要小一些。但是任何方式的流产对人体的伤害都比较大，或许会出现并发症，比如出血感染，流产不全子宫损伤子宫内膜异位症，月经不调，继发不孕等。
两种方法各有利弊，要具体情况具体分析。
相对于人流来讲，药流对女性子宫的伤害更小。药物流产适用于怀孕7周以内的孕妇，但是药流有药流不全、失败的情况，这时候需要进一步行清宫手术。而且药流的药物需要在肝功能正常的情况下才能服用。
人流是直接使用工具将胚胎吸出宫腔，手术相对来说成功概率高，手术后出血较少，恢复快。但手术会对子宫内膜造成损伤，有宫颈裂伤，子宫穿孔等风险，会对日后生育、月经造成影响。
药流指药物流产，人流指人工流产，二者相比，药物流产通常比较好。
药物流产与人工流产均为终止妊娠的方式，其中，药物流产相对于人工流产来说要好很多，对女性身体的伤害通常比较小。
但是，这并不代表药物流产没有有副作用。如果药物流产不当，则可能出现流产不全的情况，女性可能需要再做一次清宫手术，以免影响身体健康。
需要注意的是，如果妊娠时间超过49天，通常不能进行药物流产，一般选择人工流产来终止妊娠。
人流手术较好，药流副作用明显，表现为月经周期缩短或延长，月经量增多，如果反复使用，不仅容易引起感染或大出血，还有可能导致不孕，造成终身遗憾.。过程中除可出现恶心、呕吐、腹痛、腹泻等胃肠道反应外，出血时间长、出血多是药物流产的主要副作用，用药物治疗效果差，必要时需清宫。选择人流手术较好些。