通常情况下，月经第三天查性激素六项属于经期。具体情况分析如下：
正常情况下是在月经来潮的第三到五天去医院抽血检查性激素六项，通常这个时间段属于经期，经期人体内的激素水平波动较小，比较稳定，往往可以较为准确反映身体内的内分泌的情况，如果月经结束后再去检查性激素六项，体内的激素水平迅速上升，可能会出现误差，影响到检查结果。
月经第3天查性激素六项属于卵泡期。月经第3天查性激素六项从化验的结果，可以了解到卵巢功能是否正常、促黄体生成素与促卵泡素的比值是否正常、雌二醇是否正常，并且可以了解泌乳素、雄性激素以及孕酮是否正常。在临床上主要用于月经不调、不孕不育、先天性子宫发育不良等病症辅助检查。建议月经第3天查性激素六项的时候，在空腹状态下抽血，并且在抽血之前要休息十分钟左右。
月经第2天是可以去查性激素六项的。因为性激素六项，一般是检查患者在基础的技术水平应该是在月经来潮时就进行检查的。性激素六项包括卵泡生成素、黄体生成素、睾酮、孕酮雌二醇和催乳素。
一般来说，来月经第三天属于月经期。
通常情况下，月经主要是子宫内膜发生周期性变化引起的，一般月经周期的第1-4天都属于月经期，子宫内膜脱落伴随血液可能会和宫颈粘液一起流出，从而形成月经。
此外，月经周期的第5-14天属于增殖期，在雌激素的作用下，间质、血管、内膜表面上皮、腺体可能会呈增殖性变化。月经期间女性应该注意休息，避免剧烈运动。
经量过少考虑为黄体功能不足或是气滞血瘀导致的，其次不能完全排除是流产次数过多引起的，经期注意休息避免过度劳累，保持会阴清洁干燥。到当地正规专业的妇科医院做全面检查，然后根据诊断结果调理用药治疗。
月经期一般临床是属于卵泡期，从月经来的时间一般到排卵之前，这个时间都归属于卵泡期。卵泡期结束后一般是到排卵期，排卵期后黄体期，黄体期以后月经期月经期之后，卵泡期这个时期，所以月经第三天，是属于月经期，也是属于卵泡期。