抗体水平升高时，具体治疗方法结合甲状腺功能：
第一，甲状腺自身抗体水平升高，同时伴甲状腺功能减退，一般需激素替代治疗，即左甲状腺激素片治疗。
第二，如果甲状腺抗体水平升高，同时甲状腺功能正常，则通常不需要治疗。
第三，这些抗体水平升高，同时合并甲状腺功能亢进，通常被认为很可能是Graves病，可采用药物治疗，手术治疗或碘-131治疗。
怀孕了甲状腺酶抗体高可以在医生的指导下使用药物进行治疗，同时配合日常调理。
孕妇做了甲状腺功能检测，结果显示出了高的甲状腺酶抗体，一般都是正常的。而促甲状腺含量增高、甲状腺激素偏低则是甲减，会对胎儿的生长和孕囊的生长造成一定的不良反应，建议在医师的建议下使用优甲乐进行调理。在这个过程中要有良好的生活习惯，避免熬夜，用药一个多月之后还要定期做甲亢检查。
如果体检中查出甲状腺抗体较高，提示可能有此自身免疫性甲状腺疾病可能性。
甲状腺抗体有很多种，常见的甲状腺抗体有抗甲状腺过氧化物酶抗体、抗甲状腺球蛋白抗体等。自身免疫性甲状腺疾病其中之一就是甲亢了，其一为慢性淋巴细胞性甲状腺炎，如发生抗体较高等，一方面应该检查甲状腺功能是否正常，看是否存在功能亢进或功能减退，再次是又去做甲状腺超声了，那就看甲状腺有没有弥漫性增大，判断是不是如得了哪种有关免疫性甲状腺疾病。
孕期甲状腺功能减退需要积极补充甲状腺激素。
怀孕甲状腺疾病发生时，孕早期需将TSh限制在2.5mIU·L-1以下，但在孕中期和孕晚期，TSh应保持在低于等于13.0mIU·L-1的水平。除此之外还应该有效的防止新生儿患上甲状腺癌等严重并发症，需要对本身甲状腺功能进行控制，并严格把关，然后才能将甲状腺疾病对于孕妇和胎儿的危害减少到最小。
孕期甲状腺功能异常需要及时进行治疗。
孕妇在孕期出现孕期甲状腺功能异常需要及时到医院进行诊断治疗，因为孕妇的孕期甲状腺功能异常容易造成胎儿的发育出现异常，比如智力低下、胎儿畸形等。所以孕妇在确诊甲状腺功能异常后，一定要积极在医生的指导下进行治疗。孕妇在怀孕期间需要定期进行产检、明确自身和胎儿的情况，如果出现异常需及时进行治疗。
所谓甲状腺功能若有异常，考虑了两种情况，第一，甲状腺功能减退，或甲状腺功能亢进等，即甲亢与甲减2种，一旦发生上述情况两方面，首先，要针对病人的疾病对症下药，通常采用抗甲状腺药或补充甲状腺激素治疗。
此外，可以针对其实际情况选择碘131放射治疗、手术治疗等，具体的治疗方式主要是与患者的具体情况有关，建议患者积极配合医生治疗。