新生儿甲状腺增高的原因可能是母亲患有甲状腺功能亢进症，治疗不充分。这是由母亲的甲状腺刺激性受体、抗体通过胎盘进入宝宝体内而引起的。
随着时间的推移，患儿体内甲状腺刺激性受体、抗体会自行降解，症状也逐渐减轻。多数在出生后1~3个月自我缓解，不会复发，也不会留下后遗症。另外，可能是因为新生儿甲状腺激素生理性增高。因为甲状腺激素本身有变动，新生儿T3也相应地略高于成人参考范围。
导致新生儿甲状腺偏高的原因主要有:
一，母亲患有甲亢，主要在妊娠期患甲状腺肿的女性生的宝宝身上，因女性甲亢没有完善治疗，促甲状腺素受体、抗体经胎盘进入宝宝体内，随着时间推移宝宝体内促甲状腺素受体、抗体自行降解，症状会减轻，多数在出生后1-3个月会自行缓解，不会无复发也没有后遗症。
二，可能是生理性增高，甲状腺素有波动，新生儿T3比成人参考范围略高。
新生儿促甲状腺激素偏高原因可能是先天性甲状腺功能下降。
促甲状腺激素水平在新生儿筛查项目中用于筛查先天性甲状腺功能低下。如果宝宝的促甲状腺激素升高，怀疑先天性甲状腺功能下降，需要重新检查促甲状腺激素和甲状腺激素的水平。如果仍然偏高，甲状腺激素低于正常，则表现为甲状腺功能下降，需要立即开始甲状腺激素替代治疗，定期复查调整药物剂量。可能是先天性甲状腺功能下降，也可能是甲状腺功能暂时下降。甲状腺激素水平正常，促甲状腺激素稍高，无甲状腺功能减退症状，不治疗，定期复查，甲状腺功能成熟后促甲状腺激素可正常降低。这在早产新生儿中很常见。
新生儿促甲状腺激素升高可能是先天性甲状腺功能下降或甲状腺功能暂时下降所致。
需采血复查促甲状腺激素，同时需检测血甲状腺激素水平，必要时可行甲状腺超声检查。如果甲状腺激素水平也下降，需口服左旋甲状腺素片替代治疗，定期复查甲状腺功能调整剂量。早产儿易出现暂时性甲状腺功能减退，甲状腺功能可恢复正常，直至宝宝发育成熟，甲功恢复正常。
导致促甲状腺素增高的主要因素有：
1、身体状况：身体所需的甲状腺素会随着年纪的增加而降低，而促甲状腺素也会随之上升，但如果是在正常的范围内，就不会进行任何的治疗；
2、病理情况：常见的是甲减，主要是由于缺乏代谢综合征引起的，比如怕冷、少动、懒言、进食减少等，都会出现在饮食方面。
甲状腺激素在各个年龄层的调控程度是有差异的。促甲状腺素的增高并没有什么害处，要看个人的具体状况，看有没有必要进行介入治疗。
甲状腺微粒体抗体高的原因是桥本甲状腺炎患者中存在甲状腺自身免疫反应，导致甲状腺微粒体产生抗体。
甲状腺微粒体抗体高提示桥本甲状腺炎。甲状腺炎症时，甲状腺细胞被破坏，甲状腺微粒体释放到血液中，机体发生自身免疫反应，产生甲状腺微粒体抗体，因此甲状腺微粒体抗体高。长期桥本甲状腺炎可能导致甲状腺功能下降。对甲状腺微粒体抗体高的患者，定期监测甲状腺功能，发生甲状腺功能减退时给予甲状腺激素替代治疗。