经期头痛可能与血清中的雌二醇浓度有关，根据患者的生理特点，在患者生理期前后，雌二醇的浓度一般会降低，可能会引起颅内血管和子宫内血管的张力发生较大的变化，所以，对此敏感的患者可能会出现头痛。当月经结束后，血管中的雌二醇浓度恢复正常，患者的症状可以得到缓解。或者雌激素刺激泌乳素分泌，从而前列腺素含量增加，刺激血管引发的头痛。
月经期出现头痛的原因可能是因为女性身体激素分泌不平衡，导致出现血管性头痛的症状，是比较常见的现象，但是也和女性月经期的身体状态有一定的关系。月经期雌激素减低、前列腺素分泌，导致头部血管收缩扩张引起的。
女性在月经期间出现头痛，最大的可能性是由于出现了偏头痛，偏头痛是最常见的一种原发性头痛，其特点是发作性、单侧搏动样中到重度的疼痛，疼痛发作时一般会持续4-72小时，往往会伴有恶心、呕吐、畏声、畏光等症状。
是由于女性在经期体内的雌二醇水平下降，进而导致血管的张开发生改变，容易引起血管性头痛，在经期结束后就会改善；同时本身经期出血，容易引起气血不足，加上经期精神比较敏感，容易烦躁。
雌二醇变化：生理周期时，雌二醇水平降低，致使颅内外血管及子宫血管张力发生变化，敏感者则会感觉头疼，月经过后，雌二醇的水平恢复正常，头疼症状自然可缓解；雌激素作用：包括雌二醇，刺激泌乳素分泌，进而刺激前列腺素分泌，前列腺素作用于血管，引起血管收缩和扩张，导致头疼。
经期头疼是指在月经期间及其前后几天发生的头疼，属于血管性头疼的一种。主要是由于血中雌二醇浓度降低，引起头部血管对血清素（5-羟色胺）的敏感性增强而使血管张力发生变化。应当合理饮食营养，调整心理状态。