霉菌性食管炎可以吃制霉菌素片、奥美拉唑或是兰索拉唑等药。
首先，针对霉菌用药。可以选择制霉菌素片对抗真菌感染，还可以根据具体霉菌类型选择敏感药物。其次，如果有反酸、胸骨后疼痛的症状，可以选择用奥美拉唑或是兰索拉唑这类质子泵抑制剂控制胃酸分泌，减少反流可能。比如有打嗝、嗳气、胃胀等症状可以选择用吗丁啉、莫沙必利这类增加胃肠道动力、减少胃酸反流的机会。最后，要进行饮食调理，如果睡前半小时不进食，进食后不平躺，适当运动，荤素搭配。
考虑跟真菌感染、体质差、病程长、不良的饮食习惯和生活习惯有关系，需要及时使用药物治疗才行，注意饮食清淡、规律、容易消化，不要抽烟喝酒，不要暴饮暴食，避免劳累，定期复查。
食管炎的常规药物治疗主要有抑酸剂，如奥美拉唑、泮托拉唑、雷贝拉唑等质子泵抑制剂以及替丁类药物如西咪替丁、法莫替丁雷尼替丁等；还可以应用碳酸镁、镁铝镁、瑞巴派特等粘膜保护剂；配合使用多潘立酮、甲氧氯普胺、西沙必利、莫沙必利，依托必利等提高胃动力；一般能够缓解症状，需要在专业的医生指导下进行治疗，避免出现不良反应。
通常来说，反流食管炎吃艾司奥美拉唑镁肠溶片、法莫替丁胶囊、枸橼酸莫沙必利胶囊、伊托必利、法莫替丁等。
反流食管炎是一种由胃十二指肠内容物反流入食管、口腔、肺部引起不适症状和（或）并发症的疾病，可能会出现反酸、烧心、胸骨后疼痛、吞咽困难、咽部异物等临床症状，通常来说，建议在医生的指导下使用药物进行治疗，常用的药物主要有艾司奥美拉唑镁肠溶片、法莫替丁胶囊、枸橼酸莫沙必利胶囊、伊托必利、法莫替丁等。
慢性胃炎反流性食管炎可以服用香砂养胃丸、元胡止痛片、左金丸、木香顺气丸、沉香顺气丸、香砂六君子等抑制胃酸分泌的药物。
除此之外，还可以口服六味安消胶囊、枳实消痞丸、健胃消食片、酵母片、益生菌、双歧杆菌等，可以帮助消化吸收。中成药要在医生的指导下辨证使用。患者治疗期间要注意饮食均衡，避免摄入辛辣刺激、油腻、高甜类食物。
反流性食管炎患者可以口服多巴胺拮抗剂，如多潘立酮、甲氧普鲁胺等，促进胃食管内容物排空，提高粘膜括约肌张力。还可以口服西沙比利、莫沙必利等，促进胃肠蠕动，加快食物排空，减少反流；另外还有拟胆碱能药，可以促进食管内酸性物质排出，改善反流症状。一般需在医生指导下使用相应的药物，避免出现不良的用药反应，损害身体健康。