怀孕40天药流和人流哪个伤害小，无法比较。二者都会对身体产生一定的影响，不能机械的认为哪个伤害小。药流适用于停经49天以内的宫内孕。药流的好处是如果服药之后胎囊可以排出，复查彩超也没有残留，那么可以避免人工流产对子宫内膜的损伤，可以避免术后宫腔粘连的发生。但是如果没有顺利的排出或者复查彩超有残留，是有可能需要清宫的，那么就和人工流产的操作方式基本类似。而且药流由于出血时间长，可能增加感染的风险。人工流产的好处是可以速战速决的解决问题，适用于孕10周以内的宫内孕。但是术后可能会引起宫腔粘连。无论人流和药流，术后都有出血、感染、二次清宫、月经不调、继发不孕的风险。
从流产方式上看，药物流产对身体的伤害相对较小，但不管药物流产还是人工流产都会伤害身体。
停经49天以内的孕妇可以采用药物流产，有75%左右的成功率，若药物流产失败，则要做清宫手术，注意清宫手术对身体伤害很大。停经12周以内的孕妇可以进行人工流产，主要是通过局部麻醉，将孕囊、胚胎组织取出体外，手术成功率很高。因此，若成功进行药物流产，对身体伤害相对较小，若药物流产失败，则可能比人工流产手术伤害更大。
怀孕初期药流和人流相比的话药流伤害会小一点。
在怀孕初期，不管药流还是人流都会对人体有一定的损害，但是两者相比药流的伤害会小一点。如果药流顺利就不需要清宫，能减少感染的几率，避免刮宫对子宫内膜造成损伤。但是也有特殊情况，药流不干净有残留，这种就要做清宫术，也会对子宫造成二次伤害。而流产虽然对子宫有一创伤，但是一般不会造成二次伤害。
无论是药流还是人流，对身体都有伤害，药流对宫颈伤害较低，但常有消化道反应，而且可能出现内膜异位、输卵管堵塞、宫腔粘连的情况。无痛人流技术，对宫颈伤害相对低，不会出现药流的副效应。基本没有子宫穿孔的发生，其它合并症如内膜异位、输卵管堵塞、宫腔粘连、妇科感染等比药流少。流产后要卧床休息，不要吃生冷的东西，多喝营养的汤。
药流对人体伤害比人流是小的，做一个彩超的检查，看一下孕囊着床的位置和大小。根据检查结果来决定药流还是无痛人流。药物流产的最佳时间就是在怀孕的49天之前做。而无痛人流的最佳时间是在怀孕的45到65天之间。
