甲沟炎的治疗方法需依据病情的轻重进行选择。轻度的甲沟炎即在指甲周围出现轻微红肿，按压后有轻微疼痛感，症状较轻的甲沟炎可自行治疗，可应用消毒剂，如碘酒等涂在指甲周围，起到消炎效果。还可口服抗生素，通常1-3天即可起到良好的治疗效果。若为严重甲沟炎，可能为真菌感染导致，口服抗生素无法起到良好的治疗效果，必要时也可以在局麻下行拔甲术，或者是甲床部分切除手术治疗。建议症状严重者及时到医院皮肤科就诊治疗。平时一定注意将指甲不要剪得过短，更不要用手拔“倒刺”，每天勤洗手脚，防止真菌滋生。
甲沟炎的最佳治疗是拔除指甲，价格一般几百或者上千元不等。甲沟炎在不严重的时候可以采取保守疗法，简单祛除甲沟内的指甲，碘伏消毒2即可，一般费用几十元即可，但是如果较严重最好是手术拔除病变指甲，搭配抗生素药物治疗，费用就会比较高一般是几百到上千元不等，每个医院收费不同。
早期甲沟炎可出现红肿热痛等症状，短时间内可化脓感染，出现甲下脓肿。甲沟炎和甲下脓肿是可以互相转化的，因此，做好早期甲沟炎的治疗十分重要，可采用热敷、理疗、外敷等措施，应用磺胺药或抗生素等消除炎症。
只要脚趾发生一丁点外伤、破损时，就用碘酒涂擦或浸泡患趾，每日4~6次，每次15~20分钟，直到皮肤发白，利用碘酒的消毒作用将病变的皮肤组织给腐蚀掉，让它重新生长，以防甲沟炎。
孕妇很多药物是用不来的，因为可能会对孩子产生影响。治疗只有外用，并且要在医生指导下才可以用，得了甲沟炎，指甲油肿痛的症状，应该积极治疗清洗局部，然后局部再涂点碘伏溶液。
应该以高锰酸钾温水浸泡，碘伏消毒，外用百多邦或鱼石脂软膏，局部没有明显化脓可以针刺放血，有脓液形成或保守治疗无效，则要考虑及时手术治疗，多吃新鲜蔬菜，水果和海带，紫菜等。坚持服用维生素。