一般情况下，治疗腱鞘囊肿主要包括观察、抽吸术、外科治疗等，具体内容如下：
腱鞘囊肿是可以自行消失的，一般不会出现明显的并发症，所以，患者可以进行保守观察，如果症状毕竟严重，患者可以通过抽吸术来进行局部的运动，一般是掌侧支撑带的屈肌腱腱鞘囊肿，或者是背腱鞘囊肿用抽吸术。如果治疗效果不理想，可以进行手术切除，手术切除的范围是完全囊腔囊肿囊壁，且有很小的复发率，治疗效果较好。
脚底腱鞘囊肿可以通过手术去除。
足底的腱鞘囊肿一般都是要做手术切除的。可以是腰椎和硬膜外联合麻醉，也可以是局部麻醉。一般是以区囊肿为中心，经皮下及深筋膜一层一层的剖开，将囊肿暴露出来，再进行彻底的外科切除。手术切除后，最好是把标本送到医院。直接观察有可能是囊肿，需要通过病理检查来排除恶性肿瘤，避免延误。此外，手术后还要注意卧床休息。
中指腱鞘囊肿的治疗方法有三种，包括挤压、局部穿刺、外科手术治疗等。
1.挤压：如果是腱鞘囊肿比较小、比较软的，可以用两个大拇指来挤压。
2.局部穿刺：在局部穿刺，再注入乙酸泼尼松。
3.外科手术治疗：如果以上两种方法都无法治愈，且患者的正常生活能力受到损害，则要进行外科切除，取下的样本必须送检。伤口要及时进行换药和杀菌。
关节腱鞘囊肿可以通过保守治疗、手术治疗等方式去除。
关节腱鞘囊肿主要是看囊肿大小。如果囊肿是在1cm左右的小囊肿，可以通过自行挤破，慢慢吸收。患者还可以遵医嘱使用醋酸泼尼松龙进行治疗。对于腱鞘囊肿如果是比较大比较硬，通过保守治疗不能解决的，就有必要积极的进行手术切除的。患者日常应该规律作息，避免熬夜，注意休息，适当的喝一些补汤，口味要清淡。
腕关节腱鞘囊肿的治疗根据囊肿的大小不同而不同，如果囊肿体积较小，发病时间较短，可以采取局部制动休息的方法缓解症状，一般情况下囊肿会自行消退。如果囊肿体积较大，发病时间较长，则不太可能自行消退。有些患者可以在家中进行局部外力挤压，以消除囊肿，但效果不明显，容易复发，需在医生指导下，使用手术切除的方式进行治疗，可达到根治的目的。
通常情况下，腱鞘囊肿中医可以通过使用药物、针刺治疗等方式进行治疗。具体情况分析如下：
使用药物：腱鞘囊肿中医治疗时，可以安静消炎镇痛膏、麝香止痛贴膏、云南白药膏等把膏药敷到患处，可以起到消肿化脓、活血行气的作用。
针刺治疗：腱鞘囊肿中医治疗时，根据囊肿的部位及症状，选择合适的穴位，可以很好的治疗腱鞘囊肿。