支原体感染不治疗可能会使疾病进一步加重，严重者可能会出现并发症。如果男性被查出支原体感染，主要是非淋菌性尿道炎，常常表现为尿道瘙痒、烧灼感、排尿困难，少数可有尿频，尿道轻度肿胀、分泌物稀薄，部分患者可无症状。如果女性被感染上支原体可能会出现白带增多、盆腔炎引起的尿道灼痛或输卵管炎等。因此患者要做到早发现早治疗，避免病情恶化，给治疗造成复杂性。
支原体感染治疗需要21天的时间。支气管炎是由支原体感染引起，如果出现严重的症状，可以通过抗感染药物进行抗感染治疗，一般情况下可以在5天内治愈。支原体肺炎是由支原体感染引起的，一般可以在10天内进行抗感染。如果是一些严重的病人，或者是有一些基础疾病的老人，可以在两个星期内进行抗感染治疗。当患者出现咳嗽加重时我们考虑出现了急性感染。
支原体感染是会传染的，支原体是一种介于细菌和病毒中间的病原微生物，通过接触或性生活进行传播，如果共用毛巾或在公共泳池进行游泳都会感染，支原体会粘附在呼吸道和泌尿生殖器官上，如果身体抵抗力比较差，造成泌尿系统、肺或者其他部位感染，所以支原体感染患者要进行隔离治疗，在患病期间不要有亲密的接触，保证个人卫生，积极配合医生治疗。
支原体感染可以通过药物治疗来进行改善。
支原体的感染可以通过服用阿奇霉素等口服的药物来缓解症状，同时还可以针对症状进行相应的处理。支原体感染会导致支气管炎和肺炎，会导致咳嗽咳痰，可以服用一些具有镇咳化痰作用的药物，同时还可以服用一些退烧药。
支原体感染进一步导致前列腺炎。有必要使用药物及时控制支原体感染进行治疗。注意清洁和卫生，少吃辛辣和刺激性的东西。支原体药敏试验可观察表现进行，以确定诊断。抗炎药物可以根据一段时间内的药物敏感性试验来选择治疗。
男性支原体感染大部分是容易治疗的，但是要尽早治疗。
如果是男性支原体感染，是指在成年人的泌尿生殖系统中存在尿素支原体和人型支原体，主要与性活动有关。可以通过打点滴来治疗，常用药物有阿奇霉素、罗红霉素、螺旋霉素等，但是要做到完全治疗，不能中断。在用药过程中尽量不要同房，避免出现交叉感染。