治疗肺脓肿的药物主要有青霉素类药物和大环内酯类药物。肺脓肿确诊后要及时进行治疗，首先要用抗生素进行积极的治疗，抗生素要覆盖厌氧菌，比如青霉素、甲硝唑、奥硝唑、克林霉素、林可霉素等，另外还要加强痰培养的检查，可以根据药敏试验更换抗生素。其次要重视痰液的引流，主要有体位引流和化痰的药物，氨溴索、桉柠檬碱、乙酰半胱氨酸等。如果出现高热症状，可以口服一些解热止痛的药物，比如美林、洛索洛芬钠、阿司匹林等。如果病人有休克症状，应进行静脉输液，并应用血管活性药物。
肺脓肿得治疗15天到20天。具体时间也需要结合病情的轻重程度以及个人的体质决定。出现肺脓肿之后，在早期要在医生指导下及时选择抗感染的方式进行改善，通常病程的时间很短，大概20天左右能够治愈。如果患者没有及时治疗，可能导致病情越来越严重，因此需要选择抗生素类的药物进行改善，整个病情可能会超过20天。也可能会成为慢性肺囊肿。
血源性肺脓肿是由于皮肤受到外伤感染或痈疖感染，而引起的内毒血症。脓毒血症栓会通过血液传播至肺部，使两肺出现炎症、坏死以及脓腔。血源性肺脓肿大多是金黄色葡萄球菌，合并成脓毒血症，因此治疗应选择抗菌治疗。在选择敏感的抗生素治疗时，应留取痰液，血液作为标本培养，以此进行抗生素的治疗。在当前治疗血源性肺脓肿，选择抗生素通常效果会比较。
肺脓肿好转状为发热、发热症状消失，咳嗽症状好转，痰液基本消失，全身肌肉酸痛、乏力症状好转，一般情况良好。建议复查肺部ct，可发现肺脓肿容腔基本吸收，少部分患者可遗留一些纤维化影。
随着肺脓肿得到有效治疗，症状好转，咳嗽、咳痰症状明显减轻，痰液量逐渐减少，体温也正常下降。对肺脓肿患者一般采用青霉素治疗，对青霉素过敏者可选择克林霉素、林可霉素等药物。
肺脓肿的治疗花费的金额不同，因为不同患者的治疗方法不同，使用的费用也不同。一些不同地区也有不同的地域差异和不同的医生，给出的一些治疗方法也有所不同，因此不能对肺脓肿治疗的具体费用进行普遍评估。对于肺脓肿患者保持良好的心态，不要有过多的心理负担，平时养成良好的生活习惯，多注意休息，喝些热水，不要过度劳累。