一般情况下，宝宝消化不良会腹泻的原因有食物不当、感染等。
1.食物不当：宝宝消化不良时，肠道中不消化的食物增多，从而使肠道内水份增加，而且食物一般会释放一些酸性物质，刺激肠蠕动，从而引起腹泻。
2.感染：当宝宝消化不良的时候，容易出现继发肠道细菌感染、病毒感染等情况，从而出现宝宝消化不良会腹泻的的情况。
消化不良容易拉肚子的原因是胃肠道功能紊乱、肠道分泌黏液等。
消化不良可能会引起腹泻，主要是因为胃肠道中存在大量的食物，会刺激胃部的粘膜，引起胃酸的分泌，从而造成胃肠道功能紊乱，引起胃肠道蠕动变快，导致肠胃中的大部分物质无法被消化和吸收。其次是消化不良会导致肠道分泌粘液，表现为粘液便和水样便。如果是因为长期腹泻导致的身体脱水，需要尽快的处理。
两岁宝宝消化不良拉肚子首先要调整好生活习惯，不要食用寒凉的食物，例如：牛油果，香蕉，奇异果，火龙果等，不要食用冰激凌，冷饮等生冷的食物，以免引起肠胃不适。平时要吃的东西要清淡易消化，不能吃太多的食物，容易导致孩子的肠胃出现问题。另外还可以通过服用一些促进消化的药物和益生菌来调整肠道菌群，比如胃酶合剂、酵母片等，布拉氏酵母菌、三联活菌等都是比较常见的。
一般来说，小孩因为肠胃的原因，经常进食会导致肠胃不适。宝宝的肠胃会堆积一些消化不良的食品，如果继续腐败、酵解会导致宝宝出现腹部疼痛、腹胀、腹泻等症状。小儿消化不良导致的拉肚子可以通过按摩来改善。按摩的方法有如下。首先要做的就是给宝宝的肚子按一下，这样可以让宝宝的肠胃更好的蠕动，让肠胃里的东西排泄出来，这样可以缓解肠胃不适。其次，按摩小儿背部的足太阳膀胱经，也可以起到消食和祛积的效果。
此外，应该保证宝宝清淡饮食，有助于改善宝宝的不适症状。
婴幼儿出现消化不良、腹泻的情况，可以适当的调节饮食，尽量不要吃油腻、生冷的食物，可以吃一些像菜粥，面条，米粉，炒面等。可以选择去乳糖的奶粉，也可以选择水解蛋白的。母乳喂养的妈妈要吃清淡的食物，避免油腻、生冷、辛辣的食物，还可以通过服用妈咪爱等益生菌来改善消化不良、腹胀等。还可以服用补液盐，预防脱水，补充体内流失的电解质，同时也能起到止泻的效果。
通常情况下，婴儿消化不良会拉肚子。具体情况分析如下：
消化不良是小儿消化内科最常见的一组临床综合征，可能会出现腹胀、早饱、嗳气、厌食、排便异常等症状，因此婴儿消化不良会拉肚子。家长可以按照医嘱给婴儿使用肠炎宁片、固本益肠片、飞扬肠胃炎胶囊等药物进行治疗。日常生活中，家长应让婴儿多加休息，多喝热水，可以在辅食中添加高蛋白食物，比如鸡蛋、牛奶、鸡肉等，以促进身体的恢复。