如果口腔里有一个透明的水泡，可以去正规的口腔科，也可以去大医院的口腔颌面外科，然后再做手术，把囊肿和腺体一起切除。如果是在口腔里出现了一个中长的透明水泡，那就是涎腺的粘液囊肿，这种囊肿是因为涎腺的导管受到损伤、狭窄或者是闭锁，导致唾液无法通过管道进入口腔，随着唾液的增多，腺体也会越来越大，最后形成一个透明的气泡。如果是在下嘴唇，那就是切除了唇腺和囊肿。如果是在舌下腺，必须将囊肿连同舌下腺一起切除，这样可以消除病因，避免再次出现。
口腔内壁上有透明的水泡，说明患有天疱疮，要做口腔临床检查、细胞学、活体组织及免疫组织化学检查。在治疗过程中要给予高蛋白高维生素饮食，保证充足的睡眠，保持良好的心情，避免感冒和继发性感染。全身使用环磷酰胺、硫唑嘌呤、甲氨喋呤、泼尼松等免疫抑制剂，配合肾上腺皮质激素。如果有水泡出现了溃烂或者有痛感，可以用氯己定含漱剂含漱，以保持口腔的清洁。
一般来说，嘴唇内侧长透明水泡可以通过以下方法治疗。
1、药物治疗：带状疱疹在唇部黏膜形成多个水泡或融合成为大泡时，需要应用泼尼松龙、维生素B族等药物治疗。有疱疹样口疮、手足口病时，可以用聚肌胞、干扰素、阿昔洛韦等药物治疗。
2、直接摘除：唇腺导管发生阻塞，有黏液性囊肿形成时，可在局麻下直接摘除。
有可能是由于经常咬下唇的不良的习惯动作，所引起的下唇的内侧粘膜黏液腺囊肿。由于下唇内存在黏液腺和腺体的导管，当不慎咬唇或者是经常咬下唇时，易造成导管堵塞的现象，就会出现黏液腺囊肿的现象。
要注意避免吸烟喝酒，避免辛辣刺激食物，按时作息不要熬夜，手部起疱疹，痒，考虑应该是过敏性的疾病引起的症状，可以涂抹氧化锌对症治疗，注意避免接触化学物品，避免长时间接触水。
口腔上长水泡通常需进行如下的处理：
1.口腔上长水泡可能是粘性囊肿引起的，一般需要手术切除。通常是由于咬唇不良习惯所致，切除后要纠正咬唇的习惯，避免复发；
2.口腔上长水泡可能与疱疹病毒有关，此时需要进行抗病毒治疗，常用的药物有利巴韦林和阿昔洛韦；
3.口腔上长水泡也有可能是过敏反应，需要进行脱敏治疗，常用的药物有西替利嗪，氯苯那敏等，能够改善患者症状。