一般情况下，附睾炎可以和以下疾病鉴别：
1.急性睾丸炎，两者都有可能是阴囊肿大，可以用超声波进行诊断：附睾炎主要是附睾肿胀，血液循环增加，而睾丸炎的症状是睾丸体积变大，而附睾是没有异常的。
2.在晚上睡觉的时候，经常会有一种突如其来的痛苦。如果是在附睾炎的时候，把阴囊抬起，可以缓解痛苦，但是如果发生了睾丸的扭伤，那么就会引起更大的痛苦。
3.附睾结核，其表现为一种串珠状的变化，而附睾和阴囊壁可能会出现粘连。
睾丸肿瘤：没有痛感，肿块与正常睾丸易于区别，前列腺液及尿常规检查均正常，必要时可以作组织病理检查。精索扭转：常见于儿童。扭转的早期，睾丸上提与附睾有清楚的界限，扭转的后期可能界限不清，如轻轻上推睾丸则发生疼痛，说明为精索扭转医学/教育网整理搜集。
抗菌药物可以用于治疗。结合热疗，有助于缓解症状和促进炎症。刚洗完澡，高温可能会加重疼痛，并有促进感染扩散的风险。冰袋、局部冷敷等的早期应用。如果发生慢性睾丸炎，广谱抗生素结合局部理疗可以帮助缓解症状。
附睾炎通常可以完全治愈，建议患者积极治疗，具体分析如下：
附睾炎能彻底根治。首先，附睾炎属于细菌、衣原体、支原体等病原微生物感染的疾病，目前临床上对急性附睾炎的药物有很好的疗效，比如头孢类抗生素、喹诺酮类抗生素、大环内酯类抗生素等，严重时可以进行输液消炎。如果是急性附睾炎，如果没有得到有效的治疗，或者是没有正确的处理，导致了慢性附睾炎的发生。对于不能用保守疗法来消除的炎症性结节，也可以通过外科手术来治愈。
附睾炎按病程可分为急性附睾炎和慢性附睾炎两种。急性附睾炎多继发于尿道、前列腺或精囊感染，慢性附睾炎常由急性期治疗不彻底而引起。过早使用热疗可加重疼痛并有促进感染扩散的危险，所以早期宜用冰袋局部冷敷。性生活和体力劳动可加重感染，故应避免。