通常情况下，精子卵子着床会小腹隐隐作痛5天左右。具体情况分析如下：
同房后，精子与卵子结合，受精卵一般需要5天左右才开始着床，着床后才能分泌人绒毛膜促性腺激素，由于患者受到人绒毛膜促性腺激素的影响，可能会出现小腹隐隐作痛的情况，一般5天左右会消失，因此精子卵子着床会小腹隐隐作痛5天左右。受精卵着床后还不是特别的稳固，在这个阶段尽量注意就不要同房。同房容易引起腹痛、阴道少量出血，严重者甚至引起先兆流产等不良的后果。
受孕的过程一般是精子与卵子结合形成受精卵在宫内着床，在一般在受精成功后5到6天可能在宫内着床，受精卵着床可能会有轻微腹部不适的症状，另外可能会有少量阴道流血的症状，但是通常也因人而异，可能有的孕妇可能没有任何不适症状。建议孕期要定期进行检查，以及孕早期要注意叶酸的服用，从而减少胎儿神经管畸形的危险。
早孕通常是不会出现小腹隐隐作痛的症状。
先兆流产或流产可导致子宫收缩，表现为轻微腹痛或肛门坠胀感，常引起阴道出血，应予以警惕，并及时处理。同时也有可能是宫外孕，有时小腹隐痛与妊娠相关，可能发生宫外孕，流产型或破裂型宫外孕，易产生少许腹腔内出血，可刺激盆腹腔腹膜导致腹痛，如出血较多，可导致失血性休克，甚至危及生命。
受精卵着床后有腹痛现象，通常持续2~3日，大部分女性腹痛症状较轻，有轻微的酸胀感。
受精卵着床于宫腔内时，子宫内膜对异物有排斥反应，此排斥反应可使子宫不规则萎缩，继而出现腹痛，胚胎着床成功即需2～3日，腹痛可持续2～3日才逐渐减轻和消失。在此期间，女性要注意保持充足的休息时间，避免引起其他不适症状。
孕晚期是胎儿快速生长的时期，胎儿的体重在孕晚期增长的最快，增大的胎儿会对子宫和周围的器官形成压迫，出现小腹痛一般属于一种正常的生理现象，只要不出现规律性的宫缩疼，没有阴道流血和胎膜早破，胎儿胎心检查结果正常一般就问题不大，可以多休息少站立来缓解。
孕中期小腹隐隐作痛可以通过生活护理来改善。
怀孕初期如果有腹部疼痛可以适当的休息，如果症状减轻了，可能是因为子宫的体积越来越大，对周边的神经、内脏造成了压力，也可能是同房时太过紧张。要经常做孕期的检查，了解宝宝的生长情况、胎动和胎心是否有问题。孕期要注意补充膳食的营养，避免出现贫血、缺钙等问题。如果腹痛还在继续，那就要考虑宫缩、宫颈是否缩短及扩张、超声等检查，以便早期诊断，早期处理。另外，手术中也存在一些特殊的并发症，例如因腹部压增高而导致的“食道破裂孔增宽”等。