一般情况下，肾结石进行微创手术治疗，可能痛，也可能不痛。
如果是局部麻醉，进行操作是存在一定的疼痛的。如果是在其它的麻醉下进行操作，可能不痛，但是手术完成之后，输尿管内或者肾脏内会留置相应的管道来引流尿液，可能引起疼痛。
建议患者还需要戒酒、保持良好心态、谨慎用药，并应定期复查。同时患者饮食营养要均衡，尽量不要吃辛辣、油腻的食物，多休息。
一般情况下，进行激光打肾结石时会给患者注射麻醉药物，因此患者在进行激光手术时不会感到明显疼痛，如果患者对疼痛比较敏感，可能会有微小的疼痛感。在打完肾结石后，麻醉逐渐消退，患者可能感到疼痛，不过这种疼痛要因人而异，但是对于大部分人来说，这种疼痛是可以忍受的，手术后2到3天后，这种疼痛大部分就可以彻底的缓解甚至消失。
激光肾结石碎石一般不痛建议患者积极治疗，具体分析如下：
激光肾结石碎石一般是通过软镜或者硬镜进行钬激光碎石。经输尿管镜钬激光碎石，通常采用全身麻醉或硬膜外麻醉，所以在手术过程中不会感觉到疼痛。手术后，结石排出，肾脏水肿减轻，腰痛也会有所改善，但手术过程中，可能会出现泌尿系统的损害，但疼痛一般可以忍受。
不痛的，肾结石微创手术是用麻醉药物的，麻醉分为全身麻醉和局部麻醉。做全身麻醉的病人是没有任何感觉的，而做局部麻醉一般会有穿刺的时候的不适感，不过大多是可以忍受的。手术以后一般3-5天左右就不会疼痛的了。放松心情，多喝水。
肾结石手术后尿痛是尿路感染，有尿路手术史及侵入性操作，双J管也还在输尿管里没有拔，这些都是易感的因素，很多人有管子的时候都会有那些不适。管子可以拔就早点拔，多喝水，可以去医院查个尿常规甚至尿培养，适当使用抗生素，管子拔了，结石处理干净很快就可以缓解的。
肾结石微创手术不痛苦，术后会有疼痛，但是疼痛皆为正常人可以承受的范围，不用太担心，手术后要多休息，注意卫生，避免感染的情况发生，另外饮食清淡为宜，少吃含草酸及钙质多的食物，多喝水，多排尿。