一般情况下，小儿灌肠治疗，在医疗上是不被重视的。灌肠对儿童造成的伤害有：
1.灌肠的配比较低，目前FDA认可的可以灌肠的药很少见，大多数都不能使用。
2.灌肠会损害孩子的肛门和直肠，而药物则会对直肠、肛门造成一定的伤害。
3.灌肠灌胃时，主要通过静脉途径吸收，多数经过肝内消化，造成肝损伤。
建议尽量不要让儿童灌肠，以免影响身体健康。
损坏肠道。因为孩子的肠道结构还有发育完全，属于比较脆弱的，灌肠后容易出现急性肠胃炎，损坏肠胃的正常消化功能。引发肠粘膜水肿。因为灌肠的剧烈性，导致孩子的肠胃内膜撕裂是经常有的事情，还会伴随腹痛不止的情况。
一般情况下，灌肠若按照正确的操作方法则无危害。具体分析如下：
通常来讲，灌肠是将药物灌入直肠内达到其治疗的目的，一般分为清洁灌肠和保留灌肠两种。其中，清洁灌肠适应于结直肠手术的术前准备、内镜检查前的肠道准备，还可以用于粪便嵌塞的治疗等。而保留灌肠一般对药物的量、温度有严格的要求，如温度在36度左右，药物常用量在50至100ml，此方法是治疗直肠肛门疾病和妇科炎症的常用方法。
比较小的孩子不要选择用灌肠的方式进行退烧，可以采用物理或者是药物等方式帮助孩子进行退烧。长期灌肠会对孩子的肠胃产生影响，而且一般如果温度没有超过38°五以上，可以通过退热的药物来进行治疗，灌肠退烧需在专业的医生配合下来进行使用。
一般来说，长期灌肠对人体的危害是有很多的，具体内容如下：
1.长期灌肠对肛门括约肌会有损伤，有可能出现肛门括约肌失调，从而导致大便失禁或排便反射减退。
2.长期灌肠还有可能损害肠道的黏膜，药物洗剂肠道黏膜，容易增加患病的风险。
患者在治疗期间注意清淡、易消化饮食，尽量避免吸烟饮酒，减少高热量、刺激性、生冷食物的摄入。还可适当进行体育锻炼，有助于增强体质。
