灰指甲用药后有时也会疼的，这属于正常反应。因为灰指甲有轻有重，如果是很轻的话，就不会疼，如果严重了，用药后也会疼的。因为灰指甲恢复期是需要很长时间的。以选择使用其他的抗真菌的药物之类的药物，可以用清水清洗患处，可以去医院皮肤科就诊吧。
通常来讲，灰指甲包药后出现疼痛感属于正常现象，等待一段时间即可恢复正常。灰指甲是一种真菌感染引起的甲部病变，利用抗真菌的外用药进行包埋是比较有效的治疗方法，如果出现了疼痛的情况可能是药物进入了深层组织，疼痛会在一段时间后恢复，不用过于紧张。一般用于灰指甲治疗的外用药物常以亮甲牌复方聚维酮碘搽剂为主，作为一种治疗灰指甲的专用药，具有杀灭致病菌，抑制真菌再生的效果，可有效帮助灰指甲患者改善症状。症状严重时，可将亮甲联合丁克盐酸特比萘芬片、斯皮仁诺特比萘芬胶囊等抗真菌口服药物治疗。
灰指甲是由真菌感染了甲板以及甲下组织，而导致的一种常见的真菌性疾病。在临床中，绝大部分的灰指甲患者没有出现明显的疼痛。早期的时候，灰指甲患者的症状并不是非常的严重，仅仅是甲板以及甲下组织的病变。但如果患者的病情比较严重，指甲发生明显的破损、脱落，非常容易导致疼痛，尤其是当灰指甲发生在脚上，穿鞋的时候挤压导致剧烈的疼痛感。
灰指甲又称甲真菌病，临床上常分为远端侧位甲下型、浅表型、近端甲下型和全甲毁损型。轻度类型的甲真菌病一般不会引起疼痛。远端侧位甲下型、全甲毁损型甲真菌病如果趾甲嵌顿在皮肤里可以引起疼痛；全甲毁损型趾甲明显的增厚走路摩擦时可能引起疼痛不适；白色念珠菌感染的甲真菌病常常合并甲沟炎，局部可以出现红肿疼痛。因甲真菌病有一定的传染性需及时治疗。
灰指甲的期间不会引发疼痛的现象，所以不用担心出现灰指甲，之后更应该做好治疗措施，不然都有可能对自己的指甲造成危害，有可能危害自己的皮肤，这个季节应该注意选择药物进行调理。
指甲早期不会出现疼痛，如果后期不及时治疗，导致指甲出现变形，就会出现疼痛。同时灰指甲治疗的方法有街边修甲店，手术拔甲，草本外用等。街边修甲店费用贵，治疗手法通常未经消毒，容易对指甲造成二次伤害。手术拔甲这是治疗灰指甲比较快的方法，而且很快见到效果，但是比较痛苦，对指甲造成创伤比较大，而且后期还会重新长出来。草本外用可以把灰指甲很快去除且无副作用。