通常来说，临床上推荐舌咽神经痛尽早用药，经1～2年观察，如病情渐重，需行手术，其方法有舌咽神经切断术、血管减压术等。
舌咽神经截断后可发生短期声音嘶哑和吞咽呛咳等较严重并发症，通常不宜使用；血管减压术，即寻找和分离受压舌咽神经血管，神经和血管之间用垫棉垫高，血管对舌咽神经不再产生直接受压，并发症比较少见。
一般情况下，舌咽神经痛手术比较复杂，具体内容如下：
舌咽神经痛的治疗方式有卡马西平类，可以选择保守疗法，也可以选择射频消融术作为微创疗法。舌咽神经痛的外科治疗方法比较麻烦，主要有茎突、脑外舌咽神经、微动脉减压等。目前，使用的主要是微细血管减压。因为这种情况比较麻烦，建议患者去正规的神经外科进行治疗。
舌咽神经痛手术治疗，谁也不能确保百分百安全，由于这类操作仍有一定的风险性，舌咽神经分布在颅底深部，手术需开颅，手术时一旦伤及周围神经或脑干，有可能会引起某些严重后遗症，甚至威胁生命，手术时，由显微镜进行显微镜手术，能尽可能地避免并防止上述伤害发生。
建议患者前往正规医院进行舌咽神经痛手术，同时注意术后护理。
舌咽神经痛有2种术式：
1.耳后作长4cm切口，开颅骨沿小脑及脑干间寻找舌咽神经并小心分离受压舌咽神经责任血管多为小脑后下动脉或者椎动脉并于血管与舌咽神经间垫入垫棉，这样操作并发症小，操作效果佳；
2.舌咽神经切断术当切断舌咽神经时，在短期内病人可表现为声音嘶哑和吞咽呛咳等症状，严重者可需2～3个月～6个月内插入胃管内进食，并发症较为严重。
手术治疗舌咽神经痛的效果比较好。
舌咽神经痛可以通过做舌咽神经的微血管减压手术、舌咽神经离断术、迷走神经上根离断手术等方式来治疗，手术效果一般比较好，并且并发症比较少见，很少出现听力减退、耳鸣或面瘫等症状，所以建议患者积极治疗。
患者平时应该保持环境安静和室内空气新鲜，作息规律，保持饮食清淡、营养，有利于身体恢复。
一般来说，咽神经痛手术并发症如下：
咽神经痛手术的患者可能会出现吞咽呛咳、声音嘶哑等并发症。较轻的声音嘶哑可以在术后3-5月或1年通过侧声带代偿的方式进行治疗；吞咽呛咳则需要通过胃管插管来治疗。日常生活中，患者应保持健康规律的作息，避免过累、过劳；患者可适当参加适宜的活动、锻炼，如散步、游泳等；还要及时补充水分，多吃蔬菜和水果等高纤维素食物。