性衣原体感染可见全身、呼吸道、尿道不适症状。
肺炎衣原体感染会导致急性呼吸道感染和发热、持续咳嗽，咽喉疼痛、声音嘶哑的表现。衣原体所致泌尿生殖系统感染，会导致男性尿道炎，以尿道刺痒、刺痛、灼热感、尿道分泌物多为特征。
有以上症状的患者，建议到医院就诊并及时处理。
男性衣原体体感染可表现为尿路刺激症状，如尿频，尿急，尿痛，尿不尽感。有时可出现尿道分泌物增加，有时可在阴茎上发现恶臭味和水样或白色分泌物。男性睾丸也会因衣原体感染而有肿胀感和疼痛感，再加上男性阴径头部出现红肿和酸痛等现象。
上述病症，都是衣原体感染的表现，建议患者及时就医诊治。
男性衣原体症状的危害主要有性功能减退、继发炎症等。
男性衣原体感染可能会导致男性性功能减退，诱发阳痿早泄等。支原体通过尿道感染的病人，会有尿道炎的表现，并且可以继发于慢性前列腺炎、睾丸炎及其他疾病。此外，支原体还可通过直接接触或间接接触而传播给患者。支原体也不断地侵染精道、精囊、睾丸、精子、精液等品质受到影响而导致不育。
大部分男性感染衣原体后无症状产生，也可能会出现以下不适症状：
1、反复尿痛，尿道不适，瘙痒，刺痛感或灼烧感。
2、沙眼衣原体能引起非淋球菌性尿道炎并有排尿不畅的排尿不尽感，偶见黏液丝随尿液排出，少数病人有稀薄脓性分泌物，尿道发红。
3、附睾感染会表现为附睾增大，硬化甚至刺痛，严重时可见阴囊发红。
感冒症状有鼻部症状，如打喷嚏，流鼻涕，特别是流清鼻涕；也可以出现咳嗽，咳痰，咽干，咽痛，咽痒，咽部烧灼感等咽部症状；还有味觉减退，呼吸不畅，声音嘶哑等症状。有的会有发热，全身不适，畏寒，头晕，头痛，四肢无力，关节酸痛，全身无力，恶心，呕吐，食欲减低，体重降低，腹泻，腹胀等全身及胃肠道症状。有的还会有淋巴结肿大，扁桃体肿大。
衣原体肺炎发病比较急骤，初期以发热，头痛为主，呼吸道典型症状可有咳嗽，湿啰音等，并有活动后呼吸困难，咽喉部肿胀疼痛，同时伴有捻发音，恶心和呕吐。
还有部分患者以咽炎症状出现，1~3周左右即可发展成肺炎或支气管炎等症，咳嗽加剧，并伴有可能引起肺外感染，如中耳炎、关节炎，还可合并甲状腺炎及其他疾病。