对于湿疣的治疗可以采用去除局部疣体和局部用药为主，然后配合增强全身免疫力的治疗。局部的药物治疗是常见的疗法。配合中药洗剂通过细胞毒性作用抑制疣体细胞增殖，并对湿疣病毒有抑制和杀灭的作用。这个疗法使用起来方便，不良反应少，而且复发率低。
女性疣病毒一般可以通过药物治疗、物理治疗等方式进行治疗。
女性感染疣病毒后，可能会出现寻常疣、扁平疣等。可以外用维A酸乳膏、咪喹莫特乳膏等药物进行治疗。还可以通过冷冻治疗、激光治疗等去除皮损。
在皮损没有完全消失之前不要发生性行为。尽量避免到公共游泳池游泳。
尖锐湿疣可以中西医结合治疗。西医的常规手段有常见的手术治疗对疣体组织切除、冷冻治疗使用低温冷冻使疣组织坏死、激光治疗用烧灼使疣体脱落；还有中医的药物治疗，外部熏洗、涂抹等。
疣多由人类乳头瘤病毒感染引起，可以通过皮肤的微小破损自身接种传染，从而越来越多，是具备传染性的，发现就要尽早治疗。治疗的方法主要有：药物治疗；光动力学疗法，系统或局部外用光敏剂，光照后引起局部细胞死亡，可治疗部分寻常疣、尖锐湿疣；物理疗法，冷冻疗法、电灼疗法、激光治疗、红外凝固治疗适用于数目少的寻常疣和跖疣。个别巨大疣体可行手术切除术。
跖疣的治疗可以通过局部手术来完成，而对于较小的状态可以使用局部激光或微波来去除疣。经过激光或冷冻或微波治疗后，局部皮肤会出现坏死和感染的可能性。要及时用碘伏进行局部消毒，防止感染。
寻常疣是不会转变为尖锐湿疣的。尖锐湿疣病毒要经过1-3个月的潜伏期的后，在皮肤或粘膜上长出一个或几个像小米粒大小增生物，颜色与皮肤差不多，平时有局部会有搔痒，烧灼感，一般不痛，小增生物会在短期内迅速繁殖生长，增多，生大。