衣原体感染可应用抗菌素药物治疗，如红霉素肠溶片、罗红霉素颗粒。
衣原体属于原核细胞型微生物，专性地寄生于细胞，临床常见致病性衣原体有沙眼衣原体，肺炎衣原体等。肺炎衣原体也能使人的上、下呼吸道受到感染，引起病人低热，咽痛，咳嗽。一般需要采取抗生素治疗。
平时要合理膳食，运动得当，均能提高免疫力，防患于未然。
衣原体用喹诺酮类、大环内酯类、四环素类等消炎药。
衣原体没有细胞壁的结构，因此不能应用头孢菌素和青霉素。当出现支原体和衣原体感染时，通常会用到喹诺酮类抗生素。其次可以在医生的指导下口服大环内酯类的抗生素，也可以口服四环素类的抗生素。在感染支原体和衣原体后，要及早进行治疗。另外，中医的调理效果更好。
衣原体感染用红霉素类、四环素类消炎药。
衣原体感染病人可应用红霉素，罗红霉素和阿奇霉素等红霉素类药物，疗效较好。还有四环素类药物，如四环素，盐酸米诺环素疗效亦较理想。如疗效欠佳，可选用喹诺酮类药物，例如莫西沙星，具有抗菌谱广，组织穿透力强。
但是以上药物都需要在医生的指导下使用。
衣原体肺炎发病比较急骤，初期以发热，头痛为主，呼吸道典型症状可有咳嗽，湿啰音等，并有活动后呼吸困难，咽喉部肿胀疼痛，同时伴有捻发音，恶心和呕吐。
还有部分患者以咽炎症状出现，1~3周左右即可发展成肺炎或支气管炎等症，咳嗽加剧，并伴有可能引起肺外感染，如中耳炎、关节炎，还可合并甲状腺炎及其他疾病。
肺炎衣原体感染通常有发热、咳嗽、头痛等症状。
衣原体是临床上比较常见的致病微生物，可能累及呼吸道，进而诱发肺炎，出现发热、寒战、肌痛、咳嗽、头痛、胸痛等症状，肺部通常可闻及湿性罗音。
感染后可遵医嘱使用头孢菌素、四环素等药物，以促使局部炎症消退。
衣原体感染用大环内酯类的抗生素好。
衣原体感染肺炎，可以服用大环内酯的药物，常用的药物有红霉素、阿奇霉素、罗红霉素等。患者可以根据医生的建议服用，一般服用2周以上，可以减轻感冒，防止呼吸道感染。另外，患者在平时应注意个人卫生，避免不洁的性生活。