肥胖症通常是不良生活习惯、基因遗传等因素造成的。肥胖症的病因有很多种，比如吃得太多，运动太少，卡路里的摄取超过了消耗的卡路里，从而增加了脂肪的合成，这是肥胖的物质基础。此外，脂肪代谢紊乱也会引起肥胖症，此外还有遗传也可能导致患者患有肥胖症，因为肥胖症通常呈家族聚集性，肥胖症患者后代罹患肥胖几率比普通人群更高。
肥胖症通常是因为吃得太多，动得太少，过多的热量摄入，增加脂肪合成，为肥胖症提供物质基础。另外也有许多因素与肥胖有关，如年龄，性别，种族，环境和生活方式等。也有遗传的因素，内分泌因素、环境因素，精神神经因素及其他因素引起的肥胖症。肥胖不仅会给患者带来身体上和心理上的伤害，而且还会引起一系列并发症，严重影响人们的身体健康和生活质量。提示可采用饮食控制的方法，加强锻炼，以达到矫正目的，必要时，给予药物或手术治疗。
排查儿童肥胖症要先排除继发性肥胖，而继发性肥胖主要是下丘脑肿瘤导致，还有皮脂腺增多症、甲状腺功能减退症等原因，主要有以下几种：
第一，神经内分泌源性肥胖。神经内分泌系统的疾病导致的，继发性肥胖因下丘脑和下丘脑长瘤会导致激素分泌过多，从而引起肥胖。
第二，遗传综合征。一些症状可能病因不明，如色素视网膜炎、性功能减退、小胖威利综合征、多指畸形综合征，都要到医院排查。
第三，医源性肥胖。服用某些药物，如糖皮质激素、三环类抗抑郁药等，长期服用可能导致医源性肥胖。还有颅脑手术影响下丘脑也会导致医源性肥胖。儿童肥胖症要进行排查，排除继发性肥胖，再根据原发性肥胖治疗。
肥胖症是多基因的遗传。肥胖是一种非遗传性的疾病，其原因不明，可能与遗传、环境等因素相关。肥胖是一种家族遗传的疾病，这与家庭成员的不良生活习惯有关。肥胖有家族性聚合性，但其基因基础尚未明确。同时，也不能排除一些人有共同的饮食和运动习惯，肥胖是由基因决定的。肥胖病人应该采取措施减肥，比如可以通过节食和锻炼减肥。
肥胖者除了整体的脂肪含量外，还会出现局部的脂肪增多，属于脏器型的肥胖者，而脏器型肥胖者与脏器型肥胖者之间存在着较为显著的家族化特征。通常用BMI表示，BMI与BMI的乘积是相同的。若超过28，那就是肥胖症。注重膳食营养均衡，多食用高蛋白食物、新鲜的蔬菜和水果，如新鲜的瘦肉、牛奶、鸡蛋、鱼肉、橙子等。