如果是单纯疱疹，一般会出现嘴唇上的水泡。单纯疱疹是一种传染性的疾病，主要是由于单纯疱疹病毒1型所致。单纯疱疹的起泡主要是在口角、唇缘、鼻子、脸部、眼睛、耳朵、屁股等部位。皮肤以小片的红色斑点快速肿大，形成一个或更多的水泡，泡壁变厚或变细，有明显的泡状物。在发病之前，局部病人会出现发烧、头疼、疲倦等不适。单纯性疱疹通常在1-2个星期内痊愈，不会留下伤疤。
皮肤表面出现水泡的原因很多，主要包括以下几种：病毒感染引起的水泡，比如单纯疱疹、带状疱疹、生殖器疱疹、水痘等。自体免疫反应引起的水泡，比如天疱疮、类天疱疮等。过敏反应引起的水泡，比如汗疱疹、大疱性表皮松解型药疹、敌敌畏皮炎。昆虫叮咬引起的水泡，比如丘疹性荨麻疹。五、摩擦引起的水泡，比如劳动或长时间走路引起的水泡等。
一般来说，嘴唇里长了个透明水泡可能是口腔粘膜粘液囊肿导致的。
如果是口腔粘膜粘液囊肿，那么就会出现透明的水泡。具体的病因还不清楚，一般都是因为轻微的创伤，例如，吃了什么硬物，或者是牙齿不小心咬到了，就会造成粘液腺导管破裂，从唾液中流出，渗入粘膜下。此外，还可能是因为唇部的粘膜腺体和导管增生导致的腺性唇炎。病变呈球形，半透明，表面平滑，有透明的粘液。
一般来讲，生殖器上有小水泡，主要是由于生殖器疱疹病毒引起的，这种病毒会通过性接触传染，感染后会在阴茎、阴囊、冠状沟、外阴、腹股沟、肛门等处长出透明的小水泡，水泡内液体清澈，但伴有明显的瘙痒和刺痛，可以使用阿昔洛韦、更昔洛韦等药物进行抗病毒治疗，局部使用干扰素软膏进行抗病毒治疗，一般情况下10天左右就会好转。
阴囊湿疹是湿疹中比较常见的一种，局限于阴囊皮肤，有时会延及至肛门的周围，少数可延至阴茎。阴囊湿疹的主要症状有阴囊皮肤弥漫性发红、肿胀、有剧烈瘙痒，可同时出现许多针头至米粒大小的丘疹、水疱。
皮肤上有小水泡若伴有疼痛，可能是带状疱疹，是一种病毒感染，在免疫力下降的时候方便。治疗上可以外用药膏或者用烤电进行治疗，需要按照医嘱用药，需要服用3到4周的时间，有神经痛的话可以服用止痛类药，配合治疗。