孩子指甲凹凸不平，常见的原因主要包括长期的缺乏营养，贫血或者是体内缺乏辛硫蛋白质等微量元素，可以做微量元素检测，可以明确。指甲凹凸不平，还有可能是灰指甲，因为真菌感染可以破坏甲床。
可能由于身体缺乏微量元素所导致的，可以去医院的皮肤科或者是内科做一个检查和治疗，平时的时候也应该多加注意好手指的保养，尽量的补充一些维生素或者是锌，可以很好的调节。
一般情况下，指甲盖凹凸不平有小坑可能是真菌感染、营养不良等原因导致的。
1.真菌感染：创伤后可能会导致指甲被真菌感染，造成甲癣，此时可能会出现指甲异常生长的情况，导致指甲盖凹凸不平有小坑。
2.营养不良：如果缺乏营养，可能会导致甲营养不良，造成指甲生长比较慢，导致指甲盖凹凸不平有小坑，平时要适当补充营养，多休息。
指甲凹凸不平凹甲凸甲平不是提示身体有病，缺乏微量元素钙剂造成了指甲上面有小坑的表现的，可以检查微量元素，这样就可以确诊的，然后在通过补钙的药物，食物进行补充，这样就可以改善的。
指甲凹凸不平，要看是单独某个指甲还是很多指甲都有，单独一个指甲有这种凹凸不平，往往要看是否有反复的机械刺激，比如反复的抠指甲，按压指甲等不良习惯。很多指甲都有凹凸不平现象，提示是有甲营养不良，多数和缺乏微量元素，比如缺钙缺血缺锌有关系。去医院挂皮肤科，查个微量元素。
指甲上有小坑是典型的灰指甲的前期病症，因为灰指甲的致病菌寄生在甲板里和甲床上，从而造成对指甲的侵蚀而形成的小坑症状。可以由用热水泡一下，要等待新指甲长出之后，就会消失。如果状况较重，是需要进行药物治疗。