传染性软疣并没有最佳治疗方法的说法，需要采用合适的方式进行治疗。
疣体夹除术治疗该病效果较好，用手术夹碎软疣并挤去内容物，患者还可以在医生的指导下使用斑蝥素乳膏、西多福韦软膏等药物进行治疗，对传染性软疣病毒有一定治疗的作用，治疗期间要注意清淡饮食，有利于身体恢复。
儿童传染性软疣治疗的办法比较简单，现多采取挤压或刮除法，在皮损处常规消毒后，用消过毒的小镊子夹住基底部，然后用力一提，把整个疣体取下来，也可用刮勺把疣体从基底部刮下，然后消毒，一般2～3次就可完全治愈了，如果发生感染，应先控制感染。
儿童传染性软疣，可以通过刮除、药物治疗等方式进行治疗。
1.刮除：消毒后，将传染性软疣的尖端切开，可见乳酪状的肉瘤，再用钳夹将其挤压出来。
2.药物治疗：家长可以遵医嘱给其使用维A酸乳膏、咪喹莫特乳膏等药物进行治疗，能够腐蚀疣体。
治疗期间，家长应该做好儿童的护理工作，避免搔抓。
一般来说，儿童传染性软疣的诱发因素通常是免疫功能低下。
儿童传染性软疣属于痘病毒，主要有四个类型，通常儿童传染性软疣是免疫功能低下引起的，如果在不清洁的游泳池，可能会被传染，从而增加患有传染性软疣的风险。此外，如果使用糖皮质激素或其他免疫抑制剂，也可能会导致儿童传染性软疣。
儿童平时要保持自身清洁，避免去人群多的地方。加强锻炼，增强自身抵抗力。
传染性软疣治疗方法有药物治疗、手术治疗、物理治疗等。
疣体夹除术是治疗本病的有效方法。医生会先给皮肤进行常规消毒，然后用镊子将软疣夹破，挤出其内容物最后外涂碘酊等以防细菌感染。患者还可通过，也可采用药物治疗以及冷冻、激光、电灼等物理治疗方法进行治疗。
传染性软疣有其自限性，有些病人在接受了很好的常规护理后，能自行退掉。但是由于该病传染性强，还会自身传播。
传染性软疣为传染性软疣病毒感染所致，属痘病毒科DNA病毒属，以直接接触感染为主，并可经性接触传染。如果病情严重，需适时使用抗病毒的药物进行治疗。