灰指甲的治疗需遵循科学合理的治疗方法，临床以应用抗真菌药物为主要治疗手段，不建议患者通过一些民间偏方、土方等没有科学依据的方法来治疗，以免加重病情。
感染灰指甲与真菌有密切联系，因此在治疗上需从杀灭真菌开始着手。抗真菌药物可分为口服和外用两种类型，绝大多数灰指甲患者可通过外用抗真菌药物改善症状，如亮甲复方聚维酮碘搽剂，该药是治疗灰指甲的常用药物，所含的聚维酮碘和阿司匹林能够起到杀菌抑菌、消炎止痒的作用，可改善灰指甲引起的多种不适症状。若患者症状较为严重，也可与特比萘芬、伊曲康唑等口服药物进行联用，治疗效果更好。
需注意的是，灰指甲的用药建议在医生的指导下进行，需足量足疗程，以免真菌残留，导致疾病复发。
灰指甲的发生与真菌感染有关，因此建议患者选用抗真菌药物进行治疗，配合生活护理综合改善病情。
灰指甲是由真菌感染甲板或甲床所致的甲部病变，医学上叫做甲癣或甲真菌病，绝大多数患者通过外用抗真菌药物即可得到改善，如亮甲复方聚维酮碘搽剂，该药所含的聚维酮碘和阿司匹林成分，不仅可杀菌抑菌，同时还能消炎止痒，改善灰指甲引起的不适症状。如果患者症状比较严重，出现了甲板脱落、萎缩等情况，则建议在外用抗真菌药物的同时，与口服抗真菌药物，如特比萘芬、氟康唑等进行联合治疗，可较为显著的改善灰指甲。
在日常护理方面，灰指甲患者需注意保持指（趾）甲清洁，勤剪指（趾）甲，平时尽量不要与他人共用私人物品，以免引起交叉感染。
要去除灰指甲，需要使用抗真菌的药物来治疗，临床上在医生的指导下，使用抗真菌的药膏局部涂抹治疗，也可以同时配合口服抗真菌药物治疗，在使用药膏局部治疗时需要使用刀片或者指甲锉把指甲刮薄在涂抹药物。
治疗灰指甲的话，有很强的传染性，并且非常顽固难以治好，目前对灰指甲主要的还是采取外用药物治疗，应该按照疗程有规律的进行治疗等到病情基本康复后，再坚持使用一个阶段。就能够完全治好。同时注意保持局部的干燥和清洁，不要接触脏水等。注意饮食清淡。
如果是刚刚感染的情况下，进行积极的一些抗真菌治疗的情况下，那么病情可能更容易加以控制，但是如果是得病时间比较长，而且有可能角质增生比较明显，那么所用的时间就会长一些。灰指甲本身是属于一种真菌感染，因此治疗上相对来说用时间比较长。