指甲横纹凹凸不平的原因有以下几种，考虑可能是由于缺钙引起的，可以在医生的指导给予含有维生素D和钙剂的药品来积极的进行补钙治疗。另外平时饮食上也要多吃一些含钙量高的食物，例如牛奶，豆制品。考虑可能是由于体内出现病变引起的，现在要及时的去医院做相关检查，以明确病因再针对性的治疗。平时要多注意休息。
指甲凹凸不平的横纹，大多数是由于甲床受伤等引起的。有些损伤是一过性的，也就是说再长出新指甲就没事。另外主要是缺乏维生素、微量元素，如维生素a有促进指甲的发育的作用，而微量元素锌可以协同维生素a促进指甲的发育等。
指甲上有横纹是由于甲板蛋白形成过程中暂时性受阻所致，甲横沟也可以由习惯性的抽搐畸形引起，多发生于拇指的指甲，经常习惯性用其他手指损伤拇指甲上皮以及甲板造成甲上皮的脱落，甲板中形成纵行凹陷，其周围有很多横行的沟嵴。
脚指甲有横纹通常是营养不良引起的。
脚趾甲出现横纹，通常是指甲部位营养不良导致的这种情况。一般用手触摸指甲上有一些轻微的凸起或者凹陷，并不光滑，绝大多数都是因为体内缺乏微量元素导致的。此时可以遵医嘱服用一些复合维生素，如复合维生素片。或者到医院进行微量元素检测，然后展开针对性的补充，可以有效的缓解指甲横纹的现象。
指甲上出现横沟横纹，是表示营养不良，营养不良，那就多吃些肉类（鱼肉、鸡肉等）和营养价值高的蔬菜、水果等。多吃些蔬菜水果。但无论如何，都要营养均衡搭配，还要注意饮食规律，一日三餐要按时。
指甲横纹凹凸不平属于不正常的表现，考虑和缺乏微量元素或是营养不良真菌感染引起的有关系，首先要注意合理的饮食，多吃一些高蛋白补铁的食物，要去医院化验微量元素，如果有缺乏可以补充钙铁锌观察，若有真菌感染可以结合一些抗真菌的药物治疗，注意指甲的护理。