肛门疣用多种局部疗法治疗。如激光、冷冻、电灼、手术切除等，局部涂药，敲开后用棉棒蘸药水涂到疣体上，每日一至两次，小湿疣二至三天即可彻底解决。平常一定要做好个人卫生的护理，注意好休息和饮食，而且不要有不洁的性生活。
是尖锐湿疣的情况下，用多种局部疗法治愈。如激光、冷冻、电灼、手术切除等.局部涂药可用氟尿密定注射液一支，敲开后用棉棒沾药水涂到疣体上，小湿疣二至三天即可治愈。
轻微肛门疣要治疗需要具体的时间还是需要看自己的个人情况而定，不过期间的话还是要及时的采取治疗，平常的话，一定要做好个人卫生的护理，注意好休息和饮食，而且不要有不洁的性生活。
治疗周期要看病人的严重程度，和治疗方式。尽量选择正规医院或者是国家三甲医院就诊，循序治疗才能控制病情，千万不能因为急于求医而盲目治疗，一旦用药不当或者不对症的话，就有可能造成病情加重，甚至会发展为恶性肿瘤，病人期间应该注意肛门清洁卫生，注意忌辛辣刺激食物，饮食清淡规律避免便秘。
肛门疣如果不治疗那绝对是不会在自己好的。该病的治疗一定要综合治疗联合用药，中西医结合标本兼治方能完全治好。建议中药外用，中医中药解湿毒、清热下火、活血化瘀、扶正祛邪软坚散结、培元固本、疏肝理气、内外结合调理，配合西药口服。只要你持之以恒坚持一定时间，就能治好。