灰指甲疼痛较为少见，灰指甲疼痛的发生也可能与灰指甲关系不大，而是由于其他方面的原因引起，由于同时有灰指甲，所以往往容易误认为疼痛与灰指甲有关。所以要注意排除其他身体疾病，积极治疗诱发疼痛的因素，疼痛严重者可暂时用对症的方式进行处理。
甲癣者疼痛是正常现象。病人通常不需要特殊的疼痛治疗。病人只需要治疗甲癣。对于甲癣者，治疗只需要抗真菌药物。如果病人的疼痛相对较强，可以用止痛药物来缓解疼痛。切勿私自使用药物。
灰指甲是一种真菌感染性的疾病。可以在医生的指导下外用一些抗真菌的制剂，以及口服一些抗菌药等对症治疗。但从症状来看是比较严重的，这种保守治疗的情况下很难完全治疗好，疗程是比较长的。要想快一点治疗好，就是先把病甲拔掉，然后再用药，这样疗效比较确切的。
灰指甲是一种真菌病，主要是真菌会影响到甲壳和甲下。在刚开始的时候，灰指甲还没有什么特别的感觉，但是随着灰指甲的发展，这种症状会越来越严重，比如指甲会有很大的损伤和疼痛。如果出现了强烈的痛楚，首先要明确是否是因为甲沟炎引起的。如果是因为真菌感染引起的，可能会继续恶化，需要及时进行抗菌治疗，但是在进行抗菌治疗时，也会出现一些痛苦和不舒服的症状，这是不可避免的。如果出现了甲沟感染，应及时到正规的医院皮肤科进行治疗，同时进行抗菌药物的治疗。
可以口服药物缓解疼痛，同时要停止包药，通常这个主要是可以配合涂擦药物，同时还可以配合用30%浓度的冰醋酸溶液清洗局部皮肤，配合口服抗真菌药物，可以服用相关的药物，具体用药谨遵医嘱。
可能是挤压引起的。灰指甲是手部常见皮肤病，现在，绝大多数灰指甲可以治好。常用的方法包括用小利刀刮除松脆病甲，或挫薄增厚的病甲，然后涂10%碘酒或30%冰醋酸溶液，也可把病甲浸于10%碘酒或鹅掌风特效药中，坚持治疗几个月后，即可生出新甲。