诊断方法：生殖器疱疹在生殖器上有群簇或散在的小水疱，后破溃形成糜烂或溃疡，自觉疼痛。从皮损处取标本作病毒培养，发现有单纯疱疹病毒和细胞病变。通过聚合酶链反应（PCR）等方法检测HSV-2核酸。
出现生殖器疱疹，临床上相对比较多的一个抗病毒的药物治疗，因为这个属于生殖器疱疹，单纯疱疹病毒第二个亚型感染引起的症状就是浓集的小水泡在生殖器周边出现，生殖器疱疹想要确诊的话，就是通过这个疱疹液体的一个病毒数量检查，或者是通过这个hsv病毒抗体的检测来进行分析。
如果怀疑自己感染了生殖器疱疹的话，那么可以去医院通过抽血检查或者做分泌物的培养检查来进行确诊。认证后需要及时治疗，因为生殖器疱疹很容易反复发作，令病人苦不堪言。
一般凭病史和典型临床表现即可作出诊断。必要时应结合实验室检查结果，综合判断，作出诊断。以玻片在疱底作印片，Wright染色或Giemsa染色，显微镜下可见到具特征性的多核巨细胞或核内病毒包涵体。
生殖器疱疹随即出现红斑伴群集瘙痒的小红丘疹并迅速变为多发性水疱，亦可变成脓疱。生殖器疱疹症状为自觉局部灼热感、瘙痒、疼痛明显，并可有排尿困难(常常并发膀胱炎)及步行困难。这是由于局部充血水肿所致。
生殖器疱疹是一种传染性很强，危害性很大的疾病，感染生殖器疱疹后平均大概约4～5日，外阴患部先有灼热感，旋即发生成群丘疹，而且这个病常常会复发，一旦发现要积极治疗并且不能私自停药，要彻底治疗防止反复复发。