如果是水泡很小，局部可以只外用一些止痒抗过敏的药物，但如果是水泡比较大，而且三天以上没有破裂，则需要在无菌的前提下刺破引流水疱，可以同时加用抗过敏止痒外用药。
一般情况下，宝宝蚊子咬后起水泡需要根据水泡的尺寸来进行治疗，具体分析如下：
如果是水泡很小，或者是少量的疱液，可以直接用药物治疗。炉甘石洗液是比较常见的一种，一天3-5次。在数日内，这些小泡会变得干燥、结疤、并掉落。如果是大的，要做好消炎处理，然后取出疱液，然后进行加压处理。可以服用一些抗过敏性药物。小儿可以口服氯雷他定颗粒。
通常情况下，婴儿被蚊子咬后起水泡可以通过药物来治疗。具体分析如下：
如果婴儿被蚊子咬后起水泡是由于蚊虫叮咬后引起的过敏反应，此时可以局部给予糖皮质激素乳膏外用，比如说艾洛松乳膏，如果水疱破溃需要尽量保留疱壁，局部外用硼酸溶液给予湿敷，减少渗出，缓解瘙痒。如果皮损较多，可以口服抗组胺药物，一周岁以上孩子可以口服地氯雷他定混悬液，两周岁以上孩子可以口服氯雷他定糖浆，同时不要使室内温度过高，不要搔抓，有助于加快痊愈。
可在患处涂上一些激素软膏，或用凉毛巾冷敷一会，这样可以减轻痒的感觉并消肿，同时，居住的地方也要注意时常保持通风干爽，一旦被蚊子叮咬后，不要使劲抓挠，防止皮肤里的组织液、淋巴液会渗出，肿成疱就会越抓越痒，而且还不易消退。
蚊子咬后起水泡，应该及时消毒，预防炎症感染，如果感觉出水泡有流脓流水的症状，还应该涂抹点消炎的药膏，可以用软膏治疗。平时尽量保持局部的清洁卫生，预防炎症感染。再严重则应去医院就医。
蚊子叮咬皮肤以后起水泡，可能是丘疹性荨麻疹的表现。丘疹性荨麻疹一般是由于蚊虫叮皮肤以后发生过敏反应造成的。在临床上可以出现红斑、风团、丘疹、水疱、大疱等，伴有明显的瘙痒感。注意卫生清洗，避免蚊虫再次叮咬，预防局部感染。由于本病是过敏反应引起的，所以主要是抗过敏、止痒、对症治疗。