灰指甲是一种较为顽固的皮肤疾病，因此，其治疗也会有一定的难度，注意灰指甲的主要致因是真菌感染，所以要注意保持个人卫生。还有就是多吃高蛋白饮食。外科除甲疗法就是用外科手段或者化学方法将有病的甲板去除，此方法最为常用的就是拔甲疗法。除甲疗法可以通常是一种辅助治疗，一般去除病甲后可以缩短外用抗菌药及全身治疗灰指甲的疗程。如果单纯采用外科除甲疗法较低且容易复发。
具体是不是灰指甲，需要到医院做检查化验。灰指甲是一种皮肤真菌感染导致的，又叫做甲藓。到医院做检查治疗，在感染上灰指甲时指甲会发黄，不规则脱屑，变形，增厚的症状出现，如果确诊，可以使用药物治疗。
直接镜检。可剪除病甲，浸泡于20%KOH中，待甲板部位变软之后，将其压碎进行镜检，可发现甲板中存在有真菌菌丝孢子。该项检查仅能确定存在感染，但是对于具体的真菌感染类型无法确诊。因此若是想要对真菌类型进行具体的分析确诊，还需要进行更为详细的检查，常见如病理性检查等。
灰指甲的检查主要是真菌的检查，通常会取病甲的甲表面、甲下碎屑、甲组织进行真菌镜检，看是否存在菌丝，以确诊灰指甲；为了确定致病菌种则需要将这些甲组织进行培养，确定菌种；另外如果怀疑其他疾病，比如黑色素细胞瘤引起的甲病变，则可以做其他检查，例如B超等。
首先刮取碎甲及甲下碎屑，镜下可见真菌菌丝。外部表现可见甲板失去光泽，日久甲板变脆而破损脱落。多呈灰白色，且失去光泽。甲板增厚显著，表面高低不平。其质松碎，甲下常有角蛋白及碎屑沉积。有时，甲板可与甲床分离。
灰指甲检查通常不用抽血化验。灰指甲医学上称甲癣，致病菌主要是红色毛癣菌，其次是絮状表皮菌多由于浴池，毛巾等在公共场所间接接触传染，先从一个甲面开始，逐渐发展其他甲面与甲下，临床表现为甲板增厚，甲面粗糙不平，中空或与甲床分离，即可合并甲沟炎。