疱疹病毒分为一型和二型，一型主要引起口腔溃疡，二型也叫生殖器疱疹，属于性病，主要通过性行为传播，一旦感染了生殖器疱疹，治疗虽然不难，但这个病却容易顽固性复发，一型疱疹病毒也可能在生殖器上出现感染，就相当于口腔溃疡发生在包皮上，不能称为生殖器疱疹。怀疑疱疹病毒感染，可以去医院做相关抗体检测。
梅毒跟生殖器疱疹是有很大的区别的，表面上也有一些区别梅毒主要的表现是硬下疳，一般无自觉症状，会有分泌物，大多数是单发，偶见2～3个，生殖器疱疹是多发，起初是红疹，后为，小水泡，会破溃糜烂。伴有灼烧感。梅毒的危害远比生殖器疱疹要严重。
生殖器疱疹的治疗主要是抗病毒治疗，治疗的主要的目的是缓解症状，减轻疼痛，缩短病程，以及防治一些继发性的感染。要保持局部的干净和卫生保持干燥的一个状态，每天可以用等渗的生理盐水清洗，如果明显疼痛的话，可以口服一些止痛的药物，如果合并细菌感染的话，可以外用抗真菌软膏。平时要注意卫生。
男性生殖器发生疱疹，与性生活有关。在性关系发生后，如果当时没有做好清洁措施，病菌就会通过一些被损害的皮肤、粘膜组织进入人体，从而引起的一系列疱疹问题。如果自身的抵抗力下降，也会自行引起疱疹。
带状疱疹和生殖器疱疹的病原微生物并不是同一种病毒，带状疱疹有可能起到外生殖器的部位，但是不会发展为生殖器疱疹。带状疱疹，一旦患病后可以获得永久的免疫力，不会再次发病。而生殖器疱疹，一旦感染，往往都会反复复发。