包皮过长的危害是可能会引起阴茎头炎、包皮炎。包皮过长时，由皮脂腺分泌物和上皮组织脱屑组成的包皮垢容易再包皮下蓄积，增加细菌感染的风险:发生感染后可形成粘连，影响包皮松动，可能导致继发性包茎，严重者可引起排尿难:包皮过长如果不经常清洗，蓄积的包皮垢长期刺激局部组织，可增加阴茎的发生风险。长期的包皮过长，还会导致龟头的敏感性增高，使男性出现早泄的情况。在日常生活中，有的孩子仅仅是包皮过长，可能没有任何临床不适症状。但如果为包茎，则需要及时就诊挂泌尿外科。成年男性若仍存在包皮过长，需尽早进行手术治疗。
包皮过长会导致龟头不能外露，生殖器清洁不干净，会引起包皮垢的滋生，包皮垢会刺激到龟头引发龟头炎，包皮过长是男子在成年以后，阴茎皮肤包裹龟头，使龟头不能完全外露，包皮过长对身体是没有好处的，需要及早进行包皮环切术来治疗。
包皮腔内容易藏污纳垢，阴茎癌的发病率明显增高。容易导致包皮龟头炎、慢性尿道炎、前列腺炎、膀胱炎、附睾炎等。而且包皮内的病原微生物容易传给性伙伴。临床资料表明丈夫包皮过长者妻子患宫颈癌的几率明显增高。包皮反复发炎可导致包皮与龟头粘连，甚至包皮口、尿道外口狭窄引起排尿困难，性生活疼痛。
包皮过长对男性的危害是很大的，容易引发龟头炎、尿路感染，继发前列腺疾病，影响性生活质量。因为包皮覆盖了尿道口，但仍可上翻，上翻后才可以露出龟头，龟头的敏感性比较强，会影响男性的性生活，容易导致早泄。另外，包皮过长会产生污垢滋生细菌，引起龟头炎。严重者会导致性功能障碍，甚至影响射精，有的继发前列腺炎，继而导致不育。建议平时注意卫生，每次排尿一定要上翻包皮，显露龟头冠状沟，用清水冲洗干净，可到医院泌尿科专科检查及早采取包皮手术治疗。
小儿包皮过长的危害有引发炎症以及影响发育等。
首先，小儿包皮过长会导致大量的炎性疾病，例如龟头炎、尿道发炎。包皮过长也会对身体的发育造成一定的负面作用，比如有的小孩子，很少会在洗澡的时候，将包皮掀开，让孩子的阴茎暴露出来，然后再去洗，因为他们经常会从外部冲洗，而当宝宝的身体开始发育的时候，家长们并不会意识到自己的孩子是包茎。包茎缠绕在龟头上，阻碍了其发展，因此会对其成长产生不利的作用。
包皮过长主要是由于发育因素或者是遗传因素引起的，对于单纯性包皮过长的人来说，如果个人卫生做得不好，那么就容易引起包皮龟头炎，甚至是前列腺炎以及泌尿道的感染。严重的对性生活也会有影响，造成龟头敏感性增高，出现早泄症状。