阴茎短小是男科常见的一种疾病，大多是由家族遗传、先天发育、长期频繁的手淫、包皮过长或包茎等多种原因导致，会影响性生活。保持阴部清洁卫生，多吃含锌的食物，积极治疗包皮过长和包茎，有效避免阴茎短小的发生。
阴茎短小根本的原因是遗传基因的影响。另外包皮过长会阻碍阴茎的发育。后天性的阴茎短小，主要是因睾丸萎缩引起，青少年发育期间摄入的锌原素、雄性激素、维生素E和相关蛋白营养不足，缺乏后天能量补充，起不到壮大性器官的作用。
特发性小阴茎，原因至今不明。男性出现阴茎短小跟睾丸健康也有关系，平时大家需要注意一些睾丸疾病的出现。而且要注意全面的进行调节身体，避免造成自身健康受到影响，=有效增强身体素质，避免造成更多困扰。
包皮过长会造成阴茎短小的。是需要尽快的切除包皮，而且包皮过长会导致局部的细菌滋生，容易造成各种男性疾病，平时应该多加注意好局部的卫生情况，经常性的勤翻洗，保持局部的干燥清洁，衣着宽松的内衣裤。
阴茎大小和个人体质遗传有关系，正常成人的阴茎在疲软状态下有7-9厘米，勃起以后大概就是11-16厘米。如果疲软状态下小于5厘米，而且勃起时小于10厘米，才能叫阴茎短小。作为大多数男性来讲，性成熟期是18周岁，基本发育就差不多了。
先天性阴茎短小目前仍无治疗方法。后天性的阴茎短小，主要因睾丸痿缩引起。如长其从事超声、微波、放射线、高温等作业的男性，青春期前腮脉炎合并睾丸炎。长期食用粗制棉籽油等，均可引起睾丸痿缩。