阴茎短小可以通过手术治疗。目前最有效的方法是通过阴茎延长手术。阴茎延长术是在现代微创技术的指导下，利用微创进行手术，切断阴茎浅、深韧带至耻骨弓处，使埋藏于耻骨联合前方的海绵体成为游离部分，采用微创技术，手术效果好，术后恢复快，7至10天即可拆线，不会影响性生活。最后还是要调整心态。
肥胖导致阴茎短的小该需要合理减肥，还可以通过手术进行治疗。1、既然是因为肥胖症，那就一定要瘦，最重要的是，体重减轻了，阴茎附近的肥肉就会消退，露出的阴茎就会变大。2、如果出现了很严重的问题，或者多次的减肥不成功，需要做的是在做手术的时候，因为切除了大量的包皮，也会让阴茎变得比之前长。建议家长根据小孩的具体情况，选择合适的方式来处理。
阴茎短小是属于发育期间有频繁的手淫或者是营养供应不足引起的发育不良造成的，出现这种短小的情况需要做手术延长，到当地正规的医院检查一下，如果一切正常，可以不用治疗。
成年人的阴茎大小跟种族、遗传等多种因素有关的。一般成年男性的阴茎在萎软状态下不短于3cm，在勃起状态下不短于8cm，就不属于阴茎短小的。到医院做一下检查看一下，平时要改掉手淫的不良习惯，要注意生活规律，不要经常性熬夜，要多参加体育锻炼，增强体质。
阴茎短小可以做个手术延长，将阴阜部位的隐藏阴茎暴露出来，可以延长三厘米左右，平时也可以穿英国卫裤。平时保持良好的生活饮食习惯，多吃些营养的食物，适当增加高蛋白饮食。