细菌性的包皮龟头炎主要由于细菌感染所引起，通常会出现分泌物增多，疼痛，溃疡的症状。而真菌性龟头炎是由于真菌感染所引起，通常为念珠菌，会发生剧烈的瘙痒，脱皮，潮红等现象。具体的明确，需要做检查。
龟头炎真菌感染局限于皮肤角质层的最外层，极少甚至完全没有组织反应，感染毛发时也只累及毛发表面，很少损伤毛发。龟头炎细菌感染当机体免疫功能下降时，不能充分发挥其吞噬杀灭细菌的作用，即使入侵的细菌量较少，致病力不强也能引起感染。
判断龟头炎是真菌还是细菌还是滴虫感染，简便可靠的方法就是到医院进行涂片检查，在显微镜下一目了然，然后对症治疗。急性浅表性龟头炎是龟头急性炎症，常由于创伤、摩擦、肥皂、清洁剂等刺激局部而引起。
细菌感染通常以化脓、渗出为主，而真菌感染，以龟头潮红、搔痒、分泌物多，清洗时包皮垢明显增多为主。细菌性龟头炎。保持局部清洁卫生，如有包皮过长可在感染控制后手术治疗。
病情诊断。龟头炎，细菌感染通常以化脓、渗出为主，而真菌感染，以龟头潮红、搔痒、分泌物多，清洗时包皮垢明显增多为主。细菌性龟头炎，通常使用碘伏消毒后，涂药物软膏。而真菌感染性龟头炎，使用碘伏消毒后，涂药物软膏进行治疗，并且性伴侣、脚癣都要进行治疗。
真菌感染一般会出现剧烈的瘙痒，龟头表面成干燥鳞屑状。而一般的细菌感染就没有这种瘙痒的感觉，而是呈脓性分泌和炎症渗出比较多。如果确诊是龟头炎，是需要积极地用药物进行治疗的。