真菌性龟头炎，是由真菌感染导致。很多人长期不注意卫生，包皮将龟头包住，处于阴暗潮湿的环境下导致真菌感染。也可能是同房的对象，有真菌性阴道炎，同房后感染的。感染后可能有龟头发红，龟头渗液、瘙痒，并且局部有膜状物、豆腐渣样分泌物，涂片检查可以找到真菌。确诊为真菌性龟头炎后积极治疗。
细菌性龟头炎一般会导致出现红斑红点，瘙痒疼痛等临床症状。当出现这些临床症状，需要及时到医院去做一个面诊检查。如果有分泌物，可以做分泌物涂片检查或者是培养检查。如果确诊为是细菌性龟头炎，然后再涂抹药物来进行治疗。在治疗期间避免性生活，另外要保持下体干净。
得了真菌性龟头炎，首先可以使用妇炎洁洗液或者是碳酸氢钠溶液进行冲洗。局部一定要保持清洁干燥，涂抹外用药膏，一天涂抹2~3次，坚持用药7~10天，然后再到医院取分泌物复查。真菌性龟头炎是很容易复发的，患者的生活习惯也要改善，一定要多喝水，内裤要穿全棉材质的，而且内裤要勤更换，换下之后使用开水烫20分钟，然后在太阳底下暴晒，这是杀灭真菌的好方法。
一般来说，真菌感染龟头炎可以使用药物治疗。
白色念珠菌感染会导致真菌感染性龟头炎，局部可用5%的碳酸氢钠溶液或高锰酸钾粉1:5000外洗，局部可用硝酸咪康唑软膏或克霉唑软膏外用。每日早晚用，彻底恢复要花4到6个星期。在治疗过程中，由于真菌具有极高的传染性，很容易发生交叉感染，所以穿着的内衣要用热水烫一下，放在阳光下曝晒，细菌在高温下很容易被杀死。
男性真菌性龟头炎,通常治疗主要是抗真菌的药膏进行外用。对于比较严重的真菌性龟头炎,甚至可以采用口服的酮康唑、氟康唑等药物进行治疗,同时要注意生活方式的改变,清洗内衣裤,避免内衣跟袜子一起洗。患者应该尽早前往医院，在专业医生的指导下进行治疗。患者的生活习惯也要改善，一定要多喝水，平时少吃辛辣刺激的食物，忌烟酒，保持充足的睡眠，少熬夜。
大多数都存在包皮过长的现象，龟头炎首先要到医院切除包皮，现在可以在家用淡盐水，每天清洗龟头，结合抗生素治疗，这段时间多喝水，勤换洗内裤，如果情况没有好转选择正规医院进行检查治疗。