出现龟头流脓，临床上以感染性的包皮龟头炎较多见。非感染因素多是由于包皮过长，清洁不够而产生包皮垢，便会堆积起来，刺激局部的包皮而造成龟头流脓。龟头流脓一般是龟头炎所产生的症状。因为局部并发了感染，需要进行抗菌处理，同时注意局部卫生。
龟头流脓说明有感染。要找引起感染的细菌，最常见的可能是淋球菌、支原体、衣原体感染。可以取脓液涂片检查，找是否有淋球菌、支原体、衣原体，必要时可以做脓液的细菌培养，找到有什么致病菌存在。流脓绝大多数都是淋病感染导致的，就是淋球菌感染。必须找清楚原因才可以有效的进行治疗，注意多喝水，多排尿。
龟头口流脓是尿道炎导致的，男性尿道炎分为淋菌性尿道炎和非淋菌性尿道炎，他们的治疗方式也是不一样的。需要检查尿常规分泌物的检测，明确具体的致病菌，然后使用敏感药物治疗。
龟头流脓，可由于淋球菌性尿道炎，非淋球菌性尿道炎，龟头炎或者前列腺炎等泌尿系感染性疾病所导致。出现龟头流脓往往提示有泌尿系的感染，需要到当地正规公立医院，生殖医学科或男性科，明确诊断，有针对性的治疗。
如果龟头表面有脓水可能是龟头炎，如果是尿道口内有脓液流出可能是泌尿系炎症伴前列腺炎症，念珠菌感染一般是龟头表面分泌物较多伴痒感不适，也可以是无菌性炎症、外伤、过敏等原因，所以要查明原因，对症治疗。
龟头刺痛流脓可能是淋病的可能性很大。需要通过脓液的培养，明确致病微生物种类，和药物敏感性以后，选择敏感的抗生素对症治疗三到七天，症状才能够有效地缓解的。同时配合口些清热利湿、通淋利尿的药物。