人类感染甲肝病毒后，首先在消化道中增殖，在短暂的病毒血症中，病毒又可继续在血液白细胞中增殖，然后进入肝脏，在肝细胞内复制繁殖。黄疸出现，可见巩膜、皮肤不同程度黄染，肝区痛，肝脏肿大，有压痛和叩痛，部分有脾肿大。本期可有短期大便颜色变浅，皮肤瘙痒。
包皮炎临床表现不包括灼热和瘙痒，包括翻开包皮可见糜烂、渗液甚至出血。滴虫性包皮炎症状主要表现为起丘疹和红斑，可见针头大小水疱，形成糜烂面白色念珠菌性包皮炎症状表现为表面光滑并有小疱疹，急性发作时有糜烂和渗液。
内痔初发常以无痛性便血为主要症状，血液与大便不相混，多在排便时滴血或射血。出血呈间歇性，每因饮酒、过劳、便秘或腹泻时使便血复发和加重。出血严重时可引起贫血。肛查时见齿线上粘膜呈半球状隆起，色鲜红、暗红或灰白。随着痔核增大，在排便时或咳嗽时可脱出肛外，若不及时回纳，可形成内痔嵌顿，并有分泌物溢出，肛门坠胀。
瘫痪临床表现不包括手-口-眼协调，瘫痪时手口眼是不协调的。在瘫痪开始的时候肢体可表现为肌张力减低、腱反射消失、病理征阴性；而数天以后出现肌张力痉挛性增高、腱反射亢进及病理征阳性。
直肠炎的病因不同临床表现也不尽相同，常见的表现为肛门下坠感、腹泻、里急后重、血便、黏液便或黏液血便、直肠炎轻者仅黏膜发炎。重者炎症累及黏膜下层、肌层甚至直肠周围组织，有时只是部分直肠受累，有时直肠全部甚或累及肛门。急性直肠炎长期不愈则变为慢性直肠炎，由于引发直肠炎的病因较复杂。
包皮红肿的临床表现有包皮、龟头处有轻度潮红，龟头冠状沟处有白色奶酪样分泌物。出现尿频、尿痛等症状。局部有瘙痒的感觉。如果没有上述症状，均不是包皮红肿的症状。