灌肠治疗就是将生理盐水、药物或相关润肠通便的药物，通过肛门灌入直肠的一种方法。灌肠分为清洁灌肠，还有保留灌肠，清洁灌肠主要是因为便秘的病人，排便困难，大便质硬，嵌顿到肠腔内无法排出，用生理盐水灌入肠道，以增加肠腔的压力，促进粪便的排出。
肠套叠是指一段肠管套入另一个肠腔内，容易引起腹痛，呕吐等症状，应及时去医院检查，明确后进行合理治疗，可以灌肠治疗，用空气灌肠，但是如果病情严重，灌肠效果不大，就需要进行手术治疗。
中药灌肠通常能治疗肛肠疾病及部分呼吸道疾病，具体分析如下：
中药灌肠对于结肠炎、直肠炎、痔疮、肛裂等病症，都有一定的治疗效果。中医灌肠是一种有效、快速、无不良反应的方法，这种治疗方式可以直接作用于患者的伤口，并且是完全的绿色治疗。另外，对于上呼吸道感染、肺炎、肠系膜淋巴结发炎、小儿发烧等，中医也可以进行中医灌肠。中医灌肠是一种无需全身用药，并且具有良好的消化作用，是一种很有价值的治疗方式。
灌肠可以治疗很多疾病，不同疾病选择药物也不同。最常见的是数日未大便，大便干燥，不能排出，可以用开塞露灌肠以助通便。儿科常用的是用疏解退热液灌肠退热。另外溃疡性结肠炎及克罗恩病也可以灌肠，减轻局部炎症。但无论是发烧还是炎性肠病，灌肠都是辅助治疗。还需要口服药物解决根本病因。灌肠一般侧卧位，灌肠后侧侧10分钟。
采用自动控制压力的结肠注气机，肛门插入Foley管，肛门注入气体后即见肠套叠肿块各种影像，逐渐向回盲部退缩，直至完全消失，此时可闻及气过水声，腹部中央突然隆起，可见网状或圆形充气回肠，说明肠套已复位。
中医利用灌肠的方法进行治疗盆腔炎症是有效的，比如说用草药包好了之后然后灌肠，这样可以帮助患者缓解盆腔的局部不适，从而帮助患者缓解盆腔的炎症。不过，在进行灌肠时要特别提醒：
第一点，就是不能做肛门手术，因为有痔疮，而且有大小便失禁。
第二点，不能用过温的药，否则会灼伤到肠道，造成其他的症状。
第三点，需要在临床上发现有痢疾时，不要进行灌肠。
第四点，在灌肠过程中要小心，要有医生来做，避免用力过猛，导致肠管破裂。
