怀孕空囊的原因，这要因人而异。可能是由于男性精子畸形而导致，也有可能是由于女性卵泡质量异常，或者是女性有支原体、衣原体感染，甚至是其他病毒感染，比如巨细胞病毒、弓形虫病毒都可能引起。
空囊妊娠是指胎儿发育的过程中停止发育，有染色体异常、受病菌感染以及黄体发育不足，还有其它疾病都能导致，要调理好身体，每天按时的锻炼身体，饮食要全民有营养。
如果只是偶尔一次，也有可能是精子或者是卵子质量不好，或者是说胚胎发育不好。只能观察看看。有偶尔一次胚胎停育或者是空囊，或者是生化妊娠，再继续试孕看看，如果是经常这样，系统的检查看看。
有染色体异常、受病菌感染以及黄体发育不足，还有其疾病等都能导致。怀孕前一定要做好检查，确定有怀孕条件后再准备要孩子，可以先查内分泌有没有问题，还有再查遗传因素等。
早期的原因有黄体功能不全，精神因素，垂体功能不足，染色体异常，精于或卵子缺陷等。晚期最常见的原因是宫颈内口松弛、子宫畸形、子宫肌瘤、母儿血型不合、跌损伤胎等，子宫颈内口松弛的原因为先天发育异常，分娩、手术、人工流产刮宫损伤等，第一次怀孕即出现自然流产，如果找不到病因，以后再怀孕靠盲目保胎是保不住的。