该药的副作用包括以下几方面，首先长期注射黄体酮可能会引起胎儿畸形，例如造成女性胎儿男性化或者增加脊柱裂的风险，其次打黄体酮可能会造成水钠潴留，引起孕妇体重增加，组织水肿。然后打黄体酮可能会引起患者头晕以及恶心呕吐，主要是由于黄体酮有舒张颅脑血管以及刺激胃肠道的作用。
注射黄体酮保胎，停药的标准就是流产症状消失后三天停药，继续治疗3天就可以停药，黄体酮属于孕激素可以引起恶心等症状，停药后就会缓解的，注意近几天吃易消化的食物。
通常来说，保胎黄体酮一般打几天，需要视情况而定，具体分析如下：
一些黄体酮可以起到抑制宫缩的作用，如果是由于孕酮不足引起的出血、腹痛，服用黄体酮后症状会有所改善，通常情况下服用一周左右即可恢复正常。先兆流产通过使用黄体酮也仍然继续发展为难免流产，不全流产或者完全流产很快就会停掉黄体酮，如果病情进一步恶化，那么就会导致流产。
临床上应用黄体酮保胎，一般都是确定有黄体功能不足或者确有先兆流产征象，或者反复流产的复发性流产患者。黄体酮肌注是吸收效果较好的，其实是阴道上药，再其次是口服给药。临床上一般会根据监测孕酮的值来决定肌注黄体酮的天数，如果孕酮值提升比较快，症状缓解也很好，可能很快会停止肌注，改为阴道给药或者口服；相反，如果症状改善不明显或者孕酮值提升很慢，就会一直肌注，可以用药达到妊娠12周。
子宫肌瘤后壁打黄体酮保胎会影响怀孕，但是影响的不大，定期去医院做b超检查，看是否有生长的变化。但是在怀孕期间子宫肌瘤会随着雌激素的增长而变大，就会导致流产、胎位不正及早产发生。因此孕期要注意，不要忽视。
黄体酮保胎需要打一周左右，在肌注一周后，孕激素恢复到正常水平就不用再注射黄体酮，如果孕激素上升不明显，甚至还有阴道出血现象，那就需要继续肌注黄体酮针剂。