如果精子畸形率高超过百分之20，通常是会影响到生育能力的，可严重影响精液质量，严重影响受精能力和生育能力，可导致男性不育症，性功能还会受到影响。
精子畸形率不能超过20%，当然，还需要看精子成活率、液化时间、精子活动率等指标。精子畸形率高大多数与睾丸的功能障碍有关系，如长期手淫、体质较差、营养不良、休息不好等都有可能造成障碍；另外，有的与炎症有关系，如睾丸炎等。可以先考虑中药治疗。到正规的三级医院进行诊治。
精子畸形不治疗会影响生育质量、男性的精子畸形，即使勉强受孕。也会给胎儿带来不良影响。如精子畸形可能会导致受孕后，出现胎儿畸形，或者是胚胎停育，影响生育质量。精子有畸形也会如果超出正常范围，会引起不孕。
精子质量是衡量男性生育的一个重要指标，正常的精子畸形率是40%以内。精子畸形率高使精子活动受限，减缓或抑制精子进入子宫腔受精而引起不孕症。影响精子活力和存活率。也会影响精子穿透宫颈粘液的能力，导致不孕。
会出现性功能障碍等出现倦怠乏力、纳食不香、腹胀闷等，时而出现腰膝酸软等症或伴有精索静脉曲张可有睾丸坠胀表现多无明显异常体征，伴精索静脉曲张者局部可有肿大或触痛伴前列腺炎者可有触痛及结节。