不会自然自愈。会引起无精症导致不孕症的发生。可以做一下输精管通液术，如果输精管经过通液术治疗以后通畅了，化验精液常规显示有精子活力正常，就可以正常备孕了。
输精管道阻塞的常见治疗有，肿物切除术精索精囊前列腺肿瘤或囊肿可行手术切除，尿道内口切开术或尿道成形术治疗尿道外伤所致的尿道狭窄或闭锁，人工精液囊对输精管发育不良或缺如者可采用人工精液囊收集附睾内精子再行人工受精来解决生育问题。治疗时间因人而异。
轻微输精管堵塞不会自己恢复，可以通过手术恢复，术后的恢复需要一两个月的时间。病人要注意伤口周围的卫生定期清洁伤口。避免出现细菌感染影响恢复。多休息，饮食清淡，作息规律，忌烟酒等辛辣刺激性食物。
要根据病的程度来判断治疗的时间。输精管堵塞不是一个独立的病，而是多种病造成的一种症状。进行正确的治疗，坚持治疗，减少吃那些辛辣，刺激的食物。多吃一些清淡的。
输精管堵塞医治大概1~3个月就可以了，平时要个人卫生、改变不良的生活习惯，勤洗换内裤，避免不洁的性生活，平时还要饮食清淡，不要吃辛辣的食物，多参加体育锻炼，从而提高身体素质。
输精管堵塞的治疗方法有抗感染：因生殖道感染引起的射精管口水肿一般不需手术，经抗感染及物理治疗控制炎症，水肿消退，生殖道可恢复通畅。输精管吻合术：如果梗阻在输精管，可行梗阻段切除，输精管端吻合术。积极治疗三个月就可以治好。