睾丸小的原因有可能是发育不良导致的，先摸一下睾丸的硬度是否减弱，如果又小又软，有可能跟染色体有关系，属于一种先天性的病变，比如卡尔曼氏综合症。除了睾丸变小，还会有第二性征消失，以及嗅觉不敏感，性功能障碍，无精子症等情况。所以出现睾丸较小的情况不容忽视，应该积极体检，进一步检查寻找原因，看看是否能够对症治疗。
多考虑为睾丸自身发育异常和激素水平下降而引起的这种临床表现，小睾症并不是一种自力的生殖疾病，也称细精管发育不良，这是由于睾丸和阴茎小，首要显示是男性性腺功用低减，发育前和体质性推迟的男孩的必定显示。
多是先天性疾病造成的，有先天性睾丸发育不良，是一种叫克莱恩费尔特氏综合征的疾病所引起的，还可能的原因是因有外伤、炎症等原因引起，如果感到不适需要到医院就诊治疗，无大碍不需要治疗。
睾丸小可能是睾丸萎缩造成的。青春期患过腮腺炎而伴发睾丸炎，使睾丸受损；重度精索静脉曲张症；垂体甲状腺或肾上腺等内分泌疾病；患有肝硬化，慢性肾功能衰竭，免疫性疾病及病毒感染。
睾丸偏小原因有很多。有些人自然发育就小，就像每个人高矮胖瘦不同是一样的，虽然小但只要睾丸功能正常就是正常，不需要任何治疗，也不会导致任何疾病症状。但有些人可能是下丘脑垂体性腺轴发育问题，促雄激素不足，导致睾丸小。