精子畸形率会使男性生育受阻，即使怀上的宝宝健康也得不到保证，先治疗之后再打算生育。精子畸形率超过百分之20的确是会影响到生育能力的，因为可严重影响精液质量，严重影响受精能力和生育能力，可导致男性不育症。
精子畸形是容易导致胎停育的，孕五十天会有胚芽和原始心管搏动，建议一周后进行复查的，如果还没有胎心搏动，那么胎停育的可能性比较大。需要注意休息，注意饮食，可以一周后进行超声检查的。
精子畸形率高怀孕，如果精子畸形率没有超过96%，这种怀孕，一般对胎儿没有明显不好的影响，可以正常分娩胎儿。如果精子畸形率高，超过96%，这种精子就是不健康的精子，不容易怀孕健康的宝宝。
精子畸形率高，但是怀孕了，那就说明有一个正常的精子到达了子宫腔，在输卵管和卵子相遇了，精子畸形率高只是说大部分的精子有问题，并不说明一个正常的精子都没有，同房受孕是质量非常好的精子，活力非常好的精子才能够通过宫颈管、子宫腔到达输卵管区。
精子畸形指数高怀孕了可以做人流，引起畸形精子症的原因有泌尿生殖道感染，附睾结核、精索静脉曲张等，这些病均可影响精子的质量，影响受孕。必须查清楚病根，针对性的治疗，中西医结合，自主研发的中药配方，微创手术等。
精子畸形会影响怀孕。精子畸形，通过精液分析来进行检查，在精液分析检查中包括精子形态学检查，在正常成年男性，如果形态正常的精子占比较小，考虑是畸形精子症，出现精子畸形症会影响怀孕。