诊断与鉴别诊断要点常态下阴茎长度小于3cm，横径小于9cm，或小于正常男性阴茎平均长度，很难有正常的性生活或不能站立性排尿，男性第二性征发育不全，或伴有其他生殖器官畸形。
成人的生殖器勃起是在8到10厘米是一个正常的范围，如果明显过于短小容易影响到性生活质量。到专业的泌尿外科和男科，检查激素水平或阴茎海绵体血流多普勒，这样才能通过数据来选择药物干预和物理治疗，达到一个正常的发育状态。
此外还有第二性症发育不良，无胡须、腋毛和阴毛，而且还不同程度地显出皮肤细嫩、音调尖亢、无喉结等女性的特征。除以上几点外，阴茎短小的男性还有体型改变：肥胖、乳房发育，臀部增大，身材矮小等。在精液中常常无精子，但有时可见生精细胞。
一般情况下，阴茎短小最明显的症状就是阴茎大小没有达到正常范围。建议及时就医，查明病因，对症治疗。具体情况分析如下：
阴茎短小是指在软弱状态下阴茎小于4厘米或在勃起时小于8厘米。阴茎短小属于外生殖器发育不良，主要是由于睾丸组织功能不好，分泌雄激素水平低，导致外生殖器发育迟缓。如果阴茎勃起不超过5厘米，建议做阴茎延长手术。
阴茎短小是指成年男子阴茎在常温常态条件下，其长度与周径小于正常男子的平均值，其主要副作用关键是影响正常的性生活。可以到医院就诊让医生给出明确的诊断。
阴茎短小就会造成包皮包茎，还会引起是龟头炎、前列腺炎等慢性疾病。阴茎短小不但直接影响性生活的质量，甚至诱发家庭关系的破裂。如果关于短小建议到医院就诊。