龟头真菌感染真的不多见的，可能还是混合型感染比较常见的如果是否做了龟头分泌物的培养，包括一般细菌，真菌等，然后再选用药膏治疗，建议经常清洗包皮和阴茎头，保持包皮腔内清洁和干燥。如有包皮过长或包茎时应行包皮环切术。
抗真菌药物治疗应及时，局部涂抹药膏。要注意个人卫生，每晚用药物进行清洗，然后再涂抹药膏，勤换内裤，内裤烫洗后要在太阳底下暴晒，因为真菌感染是一个不耐热的细菌，通过这种措施处理，杀灭的更彻底。
一般来说，龟头炎真菌感染可以通过以下方法进行治疗。
龟头炎真菌感染需要将患处洗净之后，涂抹杀菌抗炎的药物来进行治疗。还可以将洗过的内裤放在太阳下面暴晒，也可以有效杀菌。如果症状得不到改善，患者需要及时去往医院进行诊断治疗。
建议患者在治疗期间避免发生性生活，并且保持局部的卫生干净，穿的内裤也要以纯棉材质为主。
一般情况下，患有真菌性龟头炎，患者可以通过药物治疗、日常管理、手术治疗等方式进行治疗。具体情况分析如下：
1.遵医嘱局部外用酮康唑乳膏，每天2-3次，持续使用3-4个星期。
2.注意卫生，经常沐浴，经常更换内衣。尽量不要同房，也不要在整个过程中使用安全套。
3.脚部患有真菌性疾病，例如脚癣，一定要注意不要在搔脚后不洗手再去抓挠。
4.每天用干净的水冲洗干净。
5.积极治疗各种身体的病症，例如：糖尿病，增强身体的抵抗力。
6.包皮炎合并包皮过长的病人，在做完包皮环切后要尽快进行包皮环切术。
主要与个人卫生有关：治疗首先要尽量干燥，注意卫生，勤洗手，短裤和袜子要分开洗并定期太阳晒杀菌。注意休息，避免熬夜，避免过度劳累，避免烟酒，规律生活，加强身体锻炼。多喝水，放松心情。避免辛辣刺激饮食。
真菌性龟头炎不想反复发作要保持性生活的洁净，还要注意下阴的卫生清洁，也要注意饮食清淡，少吃辛辣刺激的食物，保持良好的生活习惯就不会反复发作龟头炎了。真菌感染的龟头炎是比较难恢复的，其实很多炎症会反复发作。